RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	GNRH1	P01148	92 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	TPM1	P09493	284 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	GRK4	P32298	578 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	LRRC63	Q05C16	580 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	ARHGEF6	Q15052	776 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	MIIP	Q5JXC2	388 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	IL31RA	Q8NI17	732 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	KIF18A	Q8NI77	898 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	TSC1	Q92574	1164 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	PSMD10	O75832	226 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	TUBB4A	P04350	444 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	INHA	P05111	366 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	HOXC6	P09630	235 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	DNM2	P50570	870 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	GHRHR	Q02643	423 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	IRF5	Q13568	498 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	MTFR1	Q15390	333 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	CEP55	Q53EZ4	464 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	DESI2	Q9BSY9	194 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	DNM3	Q9UQ16	869 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	RPTOR	Q8N122	1335 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	CYP4A11	Q02928	519 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	PPP2R5C	Q13362	524 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	ARMCX2	Q7L311	632 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	RMDN3	Q96TC7	470 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	PNMA2	Q9UL42	364 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	TTC26	A0AVF1	554 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	AR	P10275	920 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	GIT2	Q14161	759 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	TRPV1	Q8NER1	839 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	TINF2	Q9BSI4	451 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	PXMP2	Q9NR77	195 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	RGL1	Q9NZL6	768 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	KRT9	P35527	623 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	TSG101	Q99816	390 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	FANCG	O15287	622 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ADCY6	O43306	1168 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	CHMP2A	O43633	222 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	GAS7	O60861	476 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	EYA4	O95677	639 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	HMGCR	P04035	888 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC175	P0C221	793 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ITGB5	P18084	799 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	KLK7	P49862	253 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	PRMT2	P55345	433 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	PGM5	Q15124	567 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	SYCP1	Q15431	976 aa		11.2	□□□□□ -0.62

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