RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 MCM7P33993 719 aa21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 PSMC5P62195 406 aa21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 XKR3Q5GH77 459 aa21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 IER5Q5VY09 327 aa21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 MSRAQ9UJ68 235 aa21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 KIF3AQ9Y496 699 aa21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.44■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 EFCAB14O75071 495 aa21.43■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 EPHA7Q15375 998 aa21.43■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 ZNF174Q15697 407 aa21.43■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 NME8Q8N427 588 aa21.43■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 METTL13Q8N6R0 699 aa21.43■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 LINC01465Q8N7H1 131 aa21.43■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.43■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.43■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.43■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 TXKP42681 527 aa21.42■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 QARSP47897 775 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 CLCN3P51790 818 aa21.42■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 CUL4AQ13619 759 aa21.42■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 NBR1Q14596 966 aa21.42■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.42■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 ANO5Q75V66 913 aa21.42■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.42■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 CEP89Q96ST8 783 aa21.42■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 ZNF576Q9H609 170 aa21.42■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 CDHR5Q9HBB8 845 aa21.42■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 RGL1Q9NZL6 768 aa21.42■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.42■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.41■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.41■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 MAGEB2O15479 319 aa21.41■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 MTERF2Q49AM1 385 aa21.41■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 TTC38Q5R3I4 469 aa21.41■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 EFCAB12Q6NXP0 572 aa21.41■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 APBB2Q92870 758 aa21.41■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 DYDC2Q96IM9 177 aa21.41■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.41■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 LXNQ9BS40 222 aa21.41■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 M0QZ92 97 aa21.4■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 VTNP04004 478 aa21.4■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 CD52P31358 61 aa21.4■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 TRAPPC10P48553 1259 aa21.4■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 CYP4A11Q02928 519 aa21.4■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 GRIN2CQ14957 1233 aa21.4■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.4■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 GINS2Q9Y248 185 aa21.4■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 SQORQ9Y6N5 450 aa21.4■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 SLITRK3O94933 977 aa21.39■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 ARHGEF15O94989 841 aa21.39■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 GJB5O95377 273 aa21.39■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 CA3P07451 260 aa21.39■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa21.39■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 DRP2Q13474 957 aa21.39■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 KIZQ2M2Z5 673 aa21.39■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.39■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.39■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.39■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.39■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 SLC28A3Q9HAS3 691 aa21.39■■□□□ 1.01
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EDC3-211ENST00000566243 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.39■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 POTEMA6NI47 508 aa21.38■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 TLL1O43897 1013 aa21.38■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 GPR32O75388 356 aa21.38■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 AMHP03971 560 aa21.38■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 OR52Z1P0C646 297 aa21.38■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 NPEPPSP55786 919 aa21.38■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 TMEM266Q2M3C6 531 aa21.38■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 MCTP1Q6DN14 999 aa21.38■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 C4orf19Q8IY42 314 aa21.38■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.38■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 USP38Q8NB14 1042 aa21.38■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.38■■□□□ 1.01
EDC3-211ENST00000566243 PADI3Q9ULW8 664 aa21.38■■□□□ 1.01
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