RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	GDF15	Q99988	308 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	WDR64	B1ANS9	1081 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	STX6	O43752	255 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	LGR5	O75473	907 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	TIMP1	P01033	207 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	FGFR4	P22455	802 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	KLRC1	P26715	233 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	ANO5	Q75V66	913 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	CLIC6	Q96NY7	704 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	NBN	O60934	754 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	MED24	O75448	989 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	PSAP	P07602	524 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	DDIT3	P35638	169 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	POTEG	Q6S5H5	508 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	USP49	Q70CQ1	688 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF365	Q70YC5	407 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	SPRED2	Q7Z698	418 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	TOX2	Q96NM4	488 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	LXN	Q9BS40	222 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	KIAA0355	O15063	1070 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	STBD1	O95210	358 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	IQCF3	P0C7M6	154 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	MYOG	P15173	224 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	ADAM17	P78536	824 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	KRT76	Q01546	638 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	REST	Q13127	1097 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	RIT2	Q99578	217 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	SLITRK3	O94933	977 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	CHRNA1	P02708	482 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	GHR	P10912	638 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	RABGGTB	P53611	331 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	LRRC15	Q8TF66	581 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	GBP4	Q96PP9	640 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	USP20	Q9Y2K6	914 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	SI	P14410	1827 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	EMSY	Q7Z589	1322 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	KPNA6	O60684	536 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	OR52Z1	P0C646	297 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	PBX2	P40425	430 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	FPGS	Q05932	587 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	MCTP2	Q6DN12	878 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	MFSD5	Q6N075	450 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	KCNK18	Q7Z418	384 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	SERINC5	Q86VE9	423 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM143	Q96AN5	459 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	USP28	Q96RU2	1077 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	ZBBX	A8MT70	800 aa		11.33	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	OAT	P04181	439 aa		11.33	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		11.33	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	PPP2R5C	Q13362	524 aa		11.33	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		11.33	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	LONRF3	Q496Y0	759 aa		11.33	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573		Q7L0L9	218 aa		11.33	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		11.33	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		11.33	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		11.33	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.59
FAM227B-208	ENST00000559573	TCHH	Q07283	1943 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	MYO7A	Q13402	2215 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		11.33	□□□□□ -0.6

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