RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557074.1

PPP2R3C-216, Transcript of protein phosphatase 2 regulatory subunit B''gamma, human

TSL 3

Gene PPP2R3C, Length 478 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP2R3C-216	ENST00000557074	ECE1	P42892	770 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	JAM2	P57087	298 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	ARID5A	Q03989	594 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	MOGS	Q13724	837 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	ACAP1	Q15027	740 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	CRY1	Q16526	586 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	DDR2	Q16832	855 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	CDC6	Q99741	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074		Q9UFV3	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074		A0A1W2PRX2	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	SCD	O00767	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	CYP27B1	O15528	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	AMY2A	P04746	511 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	AMY2B	P19961	511 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	BMP5	P22003	454 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	CBLC	Q9ULV8	474 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	AQP7	O14520	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	SLC26A4	O43511	780 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	MME	P08473	750 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	GJA4	P35212	333 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	ADAM15	Q13444	863 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	RIN1	Q13671	783 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	CEP72	Q9P209	647 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	LMO1	P25800	156 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	AOAH	P28039	575 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	OR10A5	Q9H207	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP2R3C-216	ENST00000557074	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	GSTA4	O15217	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	FAM20B	O75063	409 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	FGR	P09769	529 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	APP	P05067	770 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	SCNN1G	P51170	649 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	HGFAC	Q04756	655 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	STIL	Q15468	1287 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074		Q6ZRM9	215 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	PRRX2	Q99811	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	FOXN1	O15353	648 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	MPIG6B	O95866	241 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	NUDT3	O95989	172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	KRT4	P19013	534 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP2R3C-216	ENST00000557074	HERVK_113	P62684	666 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms