RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 GJD2Q9UKL4 321 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 WNT7AO00755 349 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 OPLAHO14841 1288 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 ATP2A1O14983 1001 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 CAPN2P17655 700 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 PLCG1P19174 1290 aa9.71□□□□□ -0.85
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GGA3-202ENST00000538886 STX17P56962 302 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 SP2Q02086 613 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 TLE2Q04725 743 aa9.71□□□□□ -0.85
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GGA3-202ENST00000538886 TERF2Q15554 542 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.71□□□□□ -0.85
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GGA3-202ENST00000538886 TRPV6Q9H1D0 765 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 MYADML2A6NDP7 307 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 MAFGO15525 162 aa9.71□□□□□ -0.85
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GGA3-202ENST00000538886 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 RNF149Q8NC42 400 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 HTATIP2Q9BUP3 242 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.71□□□□□ -0.85
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GGA3-202ENST00000538886 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-202ENST00000538886 DENND3A2RUS2 1198 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 FGFR4P22455 802 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 ACLYP53396 1101 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 SLC39A14Q15043 492 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 LRRC41Q15345 812 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 PADI6Q6TGC4 694 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 ZBTB33Q86T24 672 aa9.71□□□□□ -0.86
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GGA3-202ENST00000538886 ELP1O95163 1332 aa9.7□□□□□ -0.86
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GGA3-202ENST00000538886 SMC2O95347 1197 aa9.7□□□□□ -0.86
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GGA3-202ENST00000538886 GHRP10912 638 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 SFNP31947 248 aa9.7□□□□□ -0.86
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GGA3-202ENST00000538886 MORN1Q5T089 497 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 GPRC5CQ9NQ84 441 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 PARP2Q9UGN5 583 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 K7ENM7 598 aa9.7□□□□□ -0.86
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GGA3-202ENST00000538886 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
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GGA3-202ENST00000538886 ZNF445P59923 1031 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 GPS2Q13227 327 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 PLCB4Q15147 1175 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 XRRA1Q6P2D8 792 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 LRSAM1Q6UWE0 723 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 KSR1Q8IVT5 923 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 SCLYQ96I15 445 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 OSMRQ99650 979 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 PLA2G4BP0C869 781 aa9.69□□□□□ -0.86
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GGA3-202ENST00000538886 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
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GGA3-202ENST00000538886 FBXL16Q8N461 479 aa9.69□□□□□ -0.86
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GGA3-202ENST00000538886 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 KIFC3Q9BVG8 833 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 DLEC1Q9Y238 1755 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 WDR90Q96KV7 1748 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 STAM2O75886 525 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 ZNF202O95125 648 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 MYBP10242 640 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-202ENST00000538886 PFKFB1P16118 471 aa9.69□□□□□ -0.86
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