RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538433.5

PPFIBP1-208, Transcript of PPFIA binding protein 1, human

TSL 3

Gene PPFIBP1, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPFIBP1-208	ENST00000538433		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MATN2	O00339	956 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	AMY2A	P04746	511 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	AMY2B	P19961	511 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ECE1	P42892	770 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	JAM2	P57087	298 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433		Q6ZSN1	163 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	UBXN4	Q92575	508 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	EXTL1	Q92935	676 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	OR10A5	Q9H207	317 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433		Q9UFV3	132 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CBLC	Q9ULV8	474 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ANKRD62	A6NC57	917 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MC4R	P32245	332 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MRE11	P49959	708 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DNM2	P50570	870 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DUSP8	Q13202	625 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PIF1	Q9H611	641 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CYP27B1	O15528	508 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	EFCAB14	O75071	495 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CRTAM	O95727	393 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CD83	Q01151	205 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MAP3K12	Q12852	859 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TBR1	Q16650	682 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CALML6	Q8TD86	181 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CFHR4	Q92496	578 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KCNK3	O14649	394 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FOXP2	O15409	715 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLC26A4	O43511	780 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MPIG6B	O95866	241 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MME	P08473	750 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DPT	Q07507	201 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FOXL1	Q12952	345 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MOGS	Q13724	837 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GRM7	Q14831	915 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ASB15	Q8WXK1	588 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TLR9	Q9NR96	1032 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75	6e-6	■■■■■ 55.1
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ASB1	Q9Y576	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SCD	O00767	359 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PPFIBP1-208	ENST00000538433	HIP1R	O75146	1068 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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