RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529440.5

SERGEF-211, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 2

Gene SERGEF, Length 439 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-211ENST00000529440 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.77□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 PRR16Q569H4 304 aa14.77□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.77□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa14.77□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 NME8Q8N427 588 aa14.77□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 LENG9Q96B70 501 aa14.77□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 BACH2Q9BYV9 841 aa14.77□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.77□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 CD320Q9NPF0 282 aa14.77□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.77□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 GINS2Q9Y248 185 aa14.77□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.77□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 EDIL3O43854 480 aa14.76□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 COL19A1Q14993 1142 aa14.76□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.76□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 RUFY3Q7L099 469 aa14.76□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 CKAP2LQ8IYA6 745 aa14.76□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.76□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 BICD2Q8TD16 824 aa14.76□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 NEK9Q8TD19 979 aa14.76□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.76□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.056e-6■■■■□ 21
SERGEF-211ENST00000529440 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.76□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.76□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.76□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 MGEA5O60502 916 aa14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 CSPG5O95196 566 aa14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 C22orf31O95567 290 aa14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 IL9P15248 144 aa14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 GATMP50440 423 aa14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 ANAPC15P60006 121 aa14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 LMAN2LQ9H0V9 348 aa14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa14.75□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 PSAPP07602 524 aa14.74□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 STAG3L1P0CL83 205 aa14.74□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 KIZQ2M2Z5 673 aa14.74□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.74□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.74□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 PLVAPQ9BX97 442 aa14.74□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.74□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.74□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.74□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.74□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.74□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.74□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 SAMM50Q9Y512 469 aa14.74□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 MSH4O15457 936 aa14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 ZNF862O60290 1169 aa14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 RPS6KA5O75582 802 aa14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 MMP1P03956 469 aa14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 VTNP04004 478 aa14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 NLRP5P59047 1200 aa14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 HYAL1Q12794 435 aa14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 CAMK1Q14012 370 aa14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 METTL13Q8N6R0 699 aa14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 GJA10Q969M2 543 aa14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 OSMRQ99650 979 aa14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 CLDND1Q9NY35 253 aa14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.73□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 WDR64B1ANS9 1081 aa14.72□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 GPR32O75388 356 aa14.72□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 ITGB1P05556 798 aa14.72□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 DNAJB1P25685 340 aa14.72□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 19.4
SERGEF-211ENST00000529440 LTBRP36941 435 aa14.72□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 USP11P51784 963 aa14.72□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 CLCN3P51790 818 aa14.72□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 UGCGQ16739 394 aa14.72□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.72□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 FAM228AQ86W67 206 aa14.72□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.72□□□□□ -0.05
SERGEF-211ENST00000529440 TBCKQ8TEA7 893 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms