RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	BTBD2	Q9BX70	525 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	CSRNP2	Q9H175	543 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
USP34-222	ENST00000498268	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	GJA4	P35212	333 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	MRE11	P49959	708 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	HERVK_113	P62684	666 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	GABRE	P78334	506 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	MOGS	Q13724	837 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	ACAP1	Q15027	740 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	ASB15	Q8WXK1	588 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	RASGRP1	O95267	797 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	KCNA6	P17658	529 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	STAT5B	P51692	787 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	PTH1R	Q03431	593 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	HGFAC	Q04756	655 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	SCLY	Q96I15	445 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268		A0A0G2JNJ9	132 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	ZNF202	O95125	648 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	GBP4	Q96PP9	640 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	OR10A5	Q9H207	317 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	OR10A2	Q9H208	303 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268		Q9UFV3	132 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	FBXO10	Q9UK96	956 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	GSTA4	O15217	222 aa		5.74	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	STAT3	P40763	770 aa		5.74	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	TGFB2	P61812	414 aa		5.74	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		5.74	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		5.74	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	DLG3	Q92796	817 aa		5.74	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		5.74	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	TLR9	Q9NR96	1032 aa		5.74	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		5.74	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		5.73	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	ACRV1	P26436	265 aa		5.73	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	SERINC3	Q13530	473 aa		5.73	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	5.73	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	RASA3	Q14644	834 aa		5.73	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	GRM7	Q14831	915 aa		5.73	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		5.73	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	CHFR	Q96EP1	664 aa		5.73	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	FAM89A	Q96GI7	184 aa		5.73	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		5.73	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		5.73	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		5.73	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	FOXP2	O15409	715 aa		5.72	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	ABHD18	Q0P651	414 aa		5.72	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		5.72	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		5.72	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		5.72	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		5.72	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	HIPK4	Q8NE63	616 aa		5.72	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		5.72	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		5.72	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		5.72	□□□□□ -1.49
USP34-222	ENST00000498268	SLC26A4	O43511	780 aa		5.71	□□□□□ -1.5
USP34-222	ENST00000498268	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
USP34-222	ENST00000498268	NAT1	P18440	290 aa		5.71	□□□□□ -1.5
USP34-222	ENST00000498268	MEOX1	P50221	254 aa		5.71	□□□□□ -1.5
USP34-222	ENST00000498268	ADAM15	Q13444	863 aa		5.71	□□□□□ -1.5
USP34-222	ENST00000498268	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		5.71	□□□□□ -1.5
USP34-222	ENST00000498268	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		5.71	□□□□□ -1.5
USP34-222	ENST00000498268	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		5.71	□□□□□ -1.5
USP34-222	ENST00000498268	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
USP34-222	ENST00000498268	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
USP34-222	ENST00000498268	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
USP34-222	ENST00000498268	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
USP34-222	ENST00000498268	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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