RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 KIF11P52732 1056 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 IL13RA1P78552 427 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 STILQ15468 1287 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 GPR20Q99678 358 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 A0A0G2JNJ9 132 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 JMJD7P0C870 316 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 MC4RP32245 332 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 RAC3P60763 192 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 HS1BP3Q53T59 392 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 LMF1Q96S06 567 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 PIF1Q9H611 641 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 MSL2Q9HCI7 577 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 FANCLQ9NW38 375 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 Q9UFV3 132 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 PLAAQ9Y263 795 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 GAS7O60861 476 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 ADCY8P40145 1251 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 KCNQ1P51787 676 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 ROM1Q03395 351 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 FEZ1Q99689 392 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 FOXB1Q99853 325 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 NEK4P51957 841 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 RRADP55042 308 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 SEC23AQ15436 765 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 KIF18BQ86Y91 864 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 PASD1Q8IV76 773 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 AHI1Q8N157 1196 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 IFT57Q9NWB7 429 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 USP35Q9P2H5 1018 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 NR2E1Q9Y466 385 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 NCAPD3P42695 1498 aa6.78□□□□□ -1.32
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RBM39-241ENST00000496183 CBX4O00257 560 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 MPIG6BO95866 241 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 ADCY1Q08828 1119 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 MOGSQ13724 837 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 ZNF460Q14592 562 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 NINJ1Q92982 152 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 AMNQ9BXJ7 453 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 DEF6Q9H4E7 631 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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RBM39-241ENST00000496183 CD83Q01151 205 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 OCRLQ01968 901 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 TTC38Q5R3I4 469 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 KANK2Q63ZY3 851 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 USP30Q70CQ3 517 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 NIM1KQ8IY84 436 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 C8orf49Q96NF6 230 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 VWA7Q9Y334 891 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 SMARCA2P51531 1590 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 CUX2O14529 1486 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 RASSF10A6NK89 507 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 ARHGAP6O43182 974 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-241ENST00000496183 SDSP20132 328 aa6.75□□□□□ -1.33
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