RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 LNPKQ9C0E8 428 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-240ENST00000495293 GPRC5CQ9NQ84 441 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-240ENST00000495293 CLEC1BQ9P126 229 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-240ENST00000495293 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RBM39-240ENST00000495293 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-240ENST00000495293 SHANK3Q9BYB0 1731 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 ARNTLO00327 626 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 SEPHS1P49903 392 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 AMPD2Q01433 879 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 TEFQ10587 303 aa5.83□□□□□ -1.48
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RBM39-240ENST00000495293 SLC15A2Q16348 729 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 INF2Q27J81 1249 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 KIAA1211LQ6NV74 962 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 TTC5Q8N0Z6 440 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 FAM26EQ8N5C1 309 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 OR6P1Q8NGX9 317 aa5.83□□□□□ -1.48
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RBM39-240ENST00000495293 COPS5Q92905 334 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
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RBM39-240ENST00000495293 GBP3Q9H0R5 595 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 USP40Q9NVE5 1235 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa5.83□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 PALLDQ8WX93 1383 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 RREB1Q92766 1687 aa5.82□□□□□ -1.48
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RBM39-240ENST00000495293 ETFBP38117 255 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 GRB10Q13322 594 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 SPATS1Q496A3 300 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 UBXN11Q5T124 520 aa5.82□□□□□ -1.48
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RBM39-240ENST00000495293 DRC1Q96MC2 740 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 SLC52A2Q9HAB3 445 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 ITGB4P16144 1822 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 NUP188Q5SRE5 1749 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 MAP3K5Q99683 1374 aa5.81□□□□□ -1.48
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RBM39-240ENST00000495293 K7ESM1 405 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 ZBTB7AO95365 584 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 ITGB3P05106 788 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 FPR2P25090 351 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 SARSP49591 514 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 RIPK4P57078 832 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-240ENST00000495293 SLC9A5Q14940 896 aa5.79□□□□□ -1.48
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