RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 BTBD2Q9BX70 525 aa6.73□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 ARHGAP6O43182 974 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 EFCAB14O75071 495 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 KCNA6P17658 529 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 COMTP21964 271 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 NFYCQ13952 458 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 OR14A2Q96R54 314 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 OR10A5Q9H207 317 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 FBXO10Q9UK96 956 aa6.72□□□□□ -1.33
SSB-211ENST00000490914 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 MOGSQ13724 837 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 PCOLCEQ15113 449 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 BRAPQ7Z569 592 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 JMYQ8N9B5 988 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 DLG3Q92796 817 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 EDAQ92838 391 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 ARMC5Q96C12 935 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 GBP4Q96PP9 640 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.71□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 A0A0G2JNJ9 132 aa6.7□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 PLSCR1O15162 318 aa6.7□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 FOXP2O15409 715 aa6.7□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 MRE11P49959 708 aa6.7□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.7□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 USP30Q70CQ3 517 aa6.7□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.7□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 EXTL1Q92935 676 aa6.7□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 Q9UFV3 132 aa6.7□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.69□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 STAT5BP51692 787 aa6.69□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 KLF10Q13118 480 aa6.69□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.69□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 NRN1LQ496H8 165 aa6.69□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.69□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.69□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 HIPK4Q8NE63 616 aa6.69□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.69□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.69□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.69□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 SLC12A8A0AV02 714 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 SDHAP31040 664 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 FOXE3Q13461 319 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 TMEM177Q53S58 311 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 OR10A2Q9H208 303 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 ASB1Q9Y576 335 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.68□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.67□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.67□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 KCNQ2O43526 872 aa6.67□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 MEOX1P50221 254 aa6.67□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 DGCR2P98153 550 aa6.67□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 HGFACQ04756 655 aa6.67□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 FOXL1Q12952 345 aa6.67□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 MIIPQ5JXC2 388 aa6.67□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.67□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.67□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 GPR135Q8IZ08 494 aa6.67□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 LILRB2Q8N423 598 aa6.67□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 WDR48Q8TAF3 677 aa6.67□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 ZNF503Q96F45 646 aa6.67□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 IRF9Q00978 393 aa6.66□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 C2orf27AQ580R0 203 aa6.66□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.66□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 MKL1Q969V6 931 aa6.66□□□□□ -1.34
SSB-211ENST00000490914 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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