RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		19.51	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		19.51	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		19.51	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		19.51	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	19.51	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	19.5	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		19.5	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	19.5	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	GAS7	O60861	476 aa		19.5	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	RB1	P06400	928 aa		19.5	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		19.5	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM20A	Q96MK3	541 aa		19.5	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	ASB2	Q96Q27	587 aa		19.5	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	YME1L1	Q96TA2	773 aa		19.5	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	19.5	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		19.5	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	CERS4	Q9HA82	394 aa		19.5	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		19.5	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	19.5	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	EPOP	A6NHQ4	379 aa		19.49	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	TBX3	O15119	743 aa		19.49	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	PPFIA3	O75145	1194 aa		19.49	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	TMOD1	P28289	359 aa		19.49	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM29	Q14134	588 aa		19.49	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		19.49	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		19.49	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	PADI3	Q9ULW8	664 aa		19.49	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		19.48	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	RFXAP	O00287	272 aa		19.48	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	C22orf31	O95567	290 aa		19.48	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	STAG3L1	P0CL83	205 aa		19.48	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	19.48	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	19.48	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		19.48	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		19.48	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	19.48	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	19.48	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	19.48	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		19.48	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF3A	Q9Y496	699 aa		19.48	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	SAMM50	Q9Y512	469 aa		19.48	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		19.47	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BNC9	293 aa		19.47	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR182	O15218	404 aa		19.47	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	19.47	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	19.47	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	PAK2	Q13177	524 aa		19.47	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPRO	Q16827	1216 aa		19.47	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		19.47	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		19.47	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		19.47	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		19.47	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		19.47	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	19.47	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	19.47	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	PPME1	Q9Y570	386 aa		19.47	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	DGKI	O75912	1065 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	LARGE1	O95461	756 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	OAT	P04181	439 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	CD52	P31358	61 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	EPC2	Q52LR7	807 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	XKR3	Q5GH77	459 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	NEK8	Q86SG6	692 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM192	Q8IY95	271 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	FIBCD1	Q8N539	461 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	PLVAP	Q9BX97	442 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	VCAN	P13611	3396 aa		19.46	■□□□□ 0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		19.45	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	UPP2	O95045	317 aa		19.45	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	CTDNEP1	O95476	244 aa		19.45	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	19.45	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	19.45	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	19.45	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	AIFM3	Q96NN9	605 aa		19.45	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP7D2	Q96T17	732 aa		19.45	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		19.45	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	19.45	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	SI	P14410	1827 aa		19.44	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF862	O60290	1169 aa		19.44	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS6KA5	O75582	802 aa		19.44	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	BMPR1A	P36894	532 aa		19.44	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP2R5C	Q13362	524 aa		19.44	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	INF2	Q27J81	1249 aa		19.44	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		19.44	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRED2	Q7Z698	418 aa		19.44	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	19.44	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	P2RX5	Q93086	422 aa		19.44	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-C	Q95604	372 aa		19.44	■□□□□ 0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	19.44	■□□□□ 0.7

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