RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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PTEN-204ENST00000487939 FBXO10Q9UK96 956 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 MROH6A6NGR9 719 aa6.28□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 CPEP16870 476 aa6.28□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 SLC9A1P19634 815 aa6.28□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.28□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 BORAQ6PGQ7 559 aa6.28□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.28□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 AMNQ9BXJ7 453 aa6.28□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 OR10A5Q9H207 317 aa6.28□□□□□ -1.4
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PTEN-204ENST00000487939 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTEN-204ENST00000487939 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 C16orf92Q96LL3 132 aa6.27□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 SPC25Q9HBM1 224 aa6.27□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
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PTEN-204ENST00000487939 FKBP9O95302 570 aa6.26□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 CD40P25942 277 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTEN-204ENST00000487939 NUDT11Q96G61 164 aa6.26□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 MAML3Q96JK9 1138 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTEN-204ENST00000487939 IFT22Q9H7X7 185 aa6.26□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 NCANO14594 1321 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTEN-204ENST00000487939 UBR7Q8N806 425 aa6.25□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 C7orf31Q8N865 590 aa6.25□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.25□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.25□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.25□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.25□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.24□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 MAFGO15525 162 aa6.24□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 BRINP1O60477 761 aa6.24□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 PHC1P78364 1004 aa6.24□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.24□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.24□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 KANK2Q63ZY3 851 aa6.24□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.24□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.24□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 AJUBAQ96IF1 538 aa6.24□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.24□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 ZMAT4Q9H898 229 aa6.24□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 EMC7Q9NPA0 242 aa6.24□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.24□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 PRRG2O14669 202 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 TGM5O43548 720 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 ULK1O75385 1050 aa6.23□□□□□ -1.41
PTEN-204ENST00000487939 ADCY8P40145 1251 aa6.23□□□□□ -1.41
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