RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.38□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 SNX14Q9Y5W7 946 aa7.38□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.38□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.38□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.37□□□□□ -1.23
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CTDSPL-208ENST00000486978 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 RSPH10B2B2RC85 870 aa7.37□□□□□ -1.23
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CTDSPL-208ENST00000486978 STAM2O75886 525 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 PARNO95453 639 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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CTDSPL-208ENST00000486978 SYCE2Q6PIF2 218 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa7.37□□□□□ -1.23
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CTDSPL-208ENST00000486978 PPTC7Q8NI37 304 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 CYP2W1Q8TAV3 490 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 IL17RAQ96F46 866 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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CTDSPL-208ENST00000486978 SEC24BO95487 1268 aa7.36□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 GGPS1O95749 300 aa7.36□□□□□ -1.23
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CTDSPL-208ENST00000486978 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.36□□□□□ -1.23
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CTDSPL-208ENST00000486978 Q6ZUG5 572 aa7.36□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.36□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 ZBTB33Q86T24 672 aa7.36□□□□□ -1.23
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CTDSPL-208ENST00000486978 SUMF1Q8NBK3 374 aa7.36□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 FLCNQ8NFG4 579 aa7.36□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 POF1BQ8WVV4 589 aa7.36□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
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CTDSPL-208ENST00000486978 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 SPATA33Q96N06 139 aa7.36□□□□□ -1.23
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CTDSPL-208ENST00000486978 AGXT2Q9BYV1 514 aa7.36□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 PSTPIP2Q9H939 334 aa7.36□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 AKAP13Q12802 2813 aa7.36□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 NID2Q14112 1375 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 FIBPO43427 364 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 PPFIA3O75145 1194 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 CTSHP09668 335 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 AOC1P19801 751 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 CDC27P30260 824 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 GATMP50440 423 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 NAPAP54920 295 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 ERVFC1P60507 584 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 SP2Q02086 613 aa7.35□□□□□ -1.23
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