RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463007.5

HDAC4-208, Transcript of histone deacetylase 4, human

TSL 1 (best)

Gene HDAC4, Length 3,158 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC4-208	ENST00000463007	MBOAT7	Q96N66	472 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	STK17A	Q9UEE5	414 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	SERPING1	P05155	500 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	SNAP25	P60880	206 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	SKOR1	P84550	965 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	HYI	Q5T013	277 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	PEX26	Q7Z412	305 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	GDF3	Q9NR23	364 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	ZBTB5	O15062	677 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	MMP10	P09238	476 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	KCNH2	Q12809	1159 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	GPBP1	Q86WP2	473 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	DNM1L	O00429	736 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	NR2F2	P24468	414 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	ADCY1	Q08828	1119 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	NAB2	Q15742	525 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	SLC18A3	Q16572	532 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	NR2E1	Q9Y466	385 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	PRLR	P16471	622 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	CDK17	Q00537	523 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	CCDC38	Q502W7	563 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	FIGN	Q5HY92	759 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	CNPY4	Q8N129	248 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	MGARP	Q8TDB4	240 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	RAD54L	Q92698	747 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	GMNC	A6NCL1	334 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	SCP2	P22307	547 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	CDC25C	P30307	473 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	FNTA	P49354	379 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	KCTD1	Q719H9	257 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	METTL13	Q8N6R0	699 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	TCP11	Q8WWU5	503 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	GLG1	Q92896	1179 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	POTEF	A5A3E0	1075 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	GFPT2	O94808	682 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	FAM107A	O95990	144 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	POTEI	P0CG38	1075 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	KRT13	P13646	458 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	PPP1R2	P41236	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	CASP5	P51878	434 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	ZNF844	Q08AG5	666 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDAC4-208	ENST00000463007	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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