RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 TAP1Q03518 808 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 B3GNT9Q6UX72 402 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 BANK1Q8NDB2 785 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 SH2D3AQ9BRG2 576 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNMB3Q9NPA1 279 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 GINS2Q9Y248 185 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 COL1A2P08123 1366 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 EPOPA6NHQ4 379 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 GJB5O95377 273 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 AMHP03971 560 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 OATP04181 439 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 SFNP31947 248 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP4R3AQ6IN85 833 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 METTL13Q8N6R0 699 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 HAS1Q92839 578 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 DLL1O00548 723 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 EFCAB14O75071 495 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 IGFBP4P22692 258 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 CLCN3P51790 818 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 RABEP1Q15276 862 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM266Q2M3C6 531 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 IER5Q5VY09 327 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 LRRC71Q8N4P6 559 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 PPM1EQ8WY54 764 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 VAV3Q9UKW4 847 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 M0QZ92 97 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 MARCH6O60337 910 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 VTNP04004 478 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP2B1P20020 1258 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 ARNTL2Q8WYA1 636 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 C8orf76Q96K31 380 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 MTUS1Q9ULD2 1270 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 USP38Q8NB14 1042 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 LINC01599Q8WXQ3 324 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 APBB2Q92870 758 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM167AQ96KS9 214 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 RAD9AQ99638 391 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 NRBP2Q9NSY0 501 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 STBD1O95210 358 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 KIZQ2M2Z5 673 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 MTERF2Q49AM1 385 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM20AQ96MK3 541 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 NCAPH2Q6IBW4 605 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 EFCAB12Q6NXP0 572 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 NME8Q8N427 588 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 RDM1Q8NG50 284 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM40Q8WWA1 233 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 PADI3Q9ULW8 664 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 LINC01553A4QN01 128 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 ENPP3O14638 875 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP2R5CQ13362 524 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 PLA2G4FQ68DD2 849 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 TOP1MTQ969P6 601 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 OSMRQ99650 979 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 SUGCTQ9HAC7 445 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 CEP131Q9UPN4 1083 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 PAK2Q13177 524 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 MICALL1Q8N3F8 863 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 AKT3Q9Y243 479 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 ST18O60284 1047 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 DRP2Q13474 957 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 XKR3Q5GH77 459 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 LINC01465Q8N7H1 131 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 TMX1Q9H3N1 280 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 PRDM6Q9NQX0 595 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 RGL1Q9NZL6 768 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 TBX3O15119 743 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR32O75388 356 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 BAG4O95429 457 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 PSMC5P62195 406 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 SPIRE1Q08AE8 756 aa26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms