RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	20.12	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		20.12	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		20.12	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		20.12	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNH6	Q9H252	994 aa		20.12	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		20.12	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		20.11	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	HBP1	O60381	514 aa		20.11	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP4A	P20648	1035 aa		20.11	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	CTNNB1	P35222	781 aa		20.11	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	20.11	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		20.11	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	20.11	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		20.11	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		20.11	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		20.11	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	20.11	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	20.11	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF302	Q9NR11	478 aa		20.11	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		20.11	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	20.11	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	COL1A2	P08123	1366 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738		M0R2N6	131 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	BACH1	O14867	736 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	DEXI	O95424	95 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	USP11	P51784	963 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	NPY5R	Q15761	445 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR16	Q569H4	304 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	IER5	Q5VY09	327 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		20.09	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		20.09	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	GRM6	O15303	877 aa		20.09	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00271	P0C7V0	271 aa		20.09	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	IRS1	P35568	1242 aa		20.09	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	MRE11	P49959	708 aa		20.09	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	NLRP5	P59047	1200 aa		20.09	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT76	Q01546	638 aa		20.09	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	NHLH1	Q02575	133 aa		20.09	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	20.09	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		20.09	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		20.09	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	NME8	Q8N427	588 aa		20.09	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXL18	Q96ME1	805 aa		20.09	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	20.09	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		20.09	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		20.08	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	ENPP3	O14638	875 aa		20.08	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	CPLX1	O14810	134 aa		20.08	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	KLRC1	P26715	233 aa		20.08	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	ANAPC15	P60006	121 aa		20.08	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	HYAL1	Q12794	435 aa		20.08	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		20.08	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		20.08	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		20.08	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	20.08	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	20.08	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		20.08	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		20.08	■□□□□ 0.81
MRPL28-203	ENST00000429738	MSH4	O15457	936 aa		20.07	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	MBTPS2	O43462	519 aa		20.07	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	CD52	P31358	61 aa		20.07	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	20.07	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	SCRN1	Q12765	414 aa		20.07	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	STK3	Q13188	491 aa		20.07	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	20.07	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	TBCK	Q8TEA7	893 aa		20.07	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	20.07	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	AIFM3	Q96NN9	605 aa		20.07	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	20.07	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	C5orf42	Q9H799	3197 aa		20.07	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIO	O75962	3097 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738		M0QZ92	97 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	PSAP	P07602	524 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	CLUL1	Q15846	466 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	GALNT17	Q6IS24	598 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	BLID	Q8IZY5	108 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC5A5	Q92911	643 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	RIT2	Q99578	217 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	PLVAP	Q9BX97	442 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		20.06	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		20.05	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		20.05	■□□□□ 0.8
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR64	B1ANS9	1081 aa		20.05	■□□□□ 0.8

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