RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 USP11P51784 963 aa15.38■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 JAG1P78504 1218 aa15.38■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 DAAM2Q86T65 1068 aa15.38■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 TPCN2Q8NHX9 752 aa15.38■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 SLC35C1Q96A29 364 aa15.38■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.38■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 KRIT1O00522 736 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 MSH4O15457 936 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ERLIN2O94905 339 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 HLA-DOAP06340 250 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 TRIM49P0CI25 452 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 TRIM49CP0CI26 452 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 TMOD1P28289 359 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 PLS1Q14651 629 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 EDRF1Q3B7T1 1238 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 CHADLQ6NUI6 762 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 PEX26Q7Z412 305 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 GLYCTKQ8IVS8 523 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM59LQ9UK28 342 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 LRRN2O75325 713 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 KDM7AQ6ZMT4 941 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 PALB2Q86YC2 1186 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 FBXL5Q9UKA1 691 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 MYO1FO00160 1098 aa15.36■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 BBOX1O75936 387 aa15.36■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 AADACL2Q6P093 401 aa15.36■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa15.36■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 RDH13Q8NBN7 331 aa15.36■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 TAS2R14Q9NYV8 317 aa15.36■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 RNF14Q9UBS8 474 aa15.36■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 CYP2J2P51589 502 aa15.36■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ATAD5Q96QE3 1844 aa15.36■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 SWAP70Q9UH65 585 aa15.36■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 MYO3BQ8WXR4 1341 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 E7EVH7 732 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 G3V3G9 751 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 OPLAHO14841 1288 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 TGFB1I1O43294 461 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 TBCAO75347 108 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 INPP5BP32019 993 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 GALCP54803 685 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 DCAF8Q5TAQ9 597 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 FRMD5Q7Z6J6 570 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 TPH2Q8IWU9 490 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 BANK1Q8NDB2 785 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 SCFD2Q8WU76 684 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ISCUQ9H1K1 167 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 EVI5O60447 810 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 RPA1P27694 616 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 CRKP46108 304 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ICA1Q05084 483 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF844Q08AG5 666 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 PTGISQ16647 500 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ARHGAP44Q17R89 818 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 TEKT1Q969V4 418 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 CAPN7Q9Y6W3 813 aa15.35■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 F5H6K3 240 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 CALUO43852 315 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 PPP1R37O75864 691 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 H2AFZP0C0S5 128 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF76P36508 570 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 KLRC3Q07444 240 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 CBWD6Q4V339 395 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 CBWD3Q5JTY5 395 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 CBWD5Q5RIA9 395 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-204ENST00000409937 FOXR2Q6PJQ5 311 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms