RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 USP38Q8NB14 1042 aa23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 TOP1MTQ969P6 601 aa23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM20AQ96MK3 541 aa23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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UBE2E3-201ENST00000392415 C22orf31O95567 290 aa23.21■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.21■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.21■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.21■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 INSL6Q9Y581 213 aa23.21■■□□□ 1.31
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM205CA6NFA0 338 aa23.2■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 OATP04181 439 aa23.2■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 PRKCEQ02156 737 aa23.2■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM29Q14134 588 aa23.2■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 UGCGQ16739 394 aa23.2■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 KRT40Q6A162 431 aa23.2■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 CERS4Q9HA82 394 aa23.2■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 REV3LO60673 3130 aa23.2■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 TTC3P53804 2025 aa23.19■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 BTBD18B2RXH4 712 aa23.19■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 TBX3O15119 743 aa23.19■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 MAGEB2O15479 319 aa23.19■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 CD52P31358 61 aa23.19■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 VCANP13611 3396 aa23.19■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP2R5CQ13362 524 aa23.18■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.18■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 HAS1Q92839 578 aa23.18■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 VAV3Q9UKW4 847 aa23.18■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 PADI3Q9ULW8 664 aa23.18■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 LINC01553A4QN01 128 aa23.17■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 EPOPA6NHQ4 379 aa23.17■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 ENPP3O14638 875 aa23.17■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 IGFBP4P22692 258 aa23.17■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 FOSBP53539 338 aa23.17■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 RABEP1Q15276 862 aa23.17■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 SPRED2Q7Z698 418 aa23.17■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 POTEDQ86YR6 584 aa23.17■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 METTL13Q8N6R0 699 aa23.17■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.17■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 RFXAPO00287 272 aa23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 UPP2O95045 317 aa23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 STBD1O95210 358 aa23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 ERVK-21P61565 698 aa23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 XKR3Q5GH77 459 aa23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 CDHR5Q9HBB8 845 aa23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 EML1O00423 815 aa23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 PAK2Q13177 524 aa23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 IL27Q8NEV9 243 aa23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 YME1L1Q96TA2 773 aa23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 GINS2Q9Y248 185 aa23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR32O75388 356 aa23.14■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 VTNP04004 478 aa23.14■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 TMOD1P28289 359 aa23.14■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 CLCN3P51790 818 aa23.14■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 PSMC5P62195 406 aa23.14■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.14■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 BANK1Q8NDB2 785 aa23.14■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM40Q8WWA1 233 aa23.14■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 LINC01599Q8WXQ3 324 aa23.14■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 C8orf76Q96K31 380 aa23.14■■□□□ 1.3
UBE2E3-201ENST00000392415 COL4A6Q14031 1691 aa23.14■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 MARCH6O60337 910 aa23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 RPS6KA5O75582 802 aa23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 KIZQ2M2Z5 673 aa23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP89Q96ST8 783 aa23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP7D2Q96T17 732 aa23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3-201ENST00000392415 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.12■■□□□ 1.29
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