RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM178BQ8IXR5 827 aa24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPLX3Q8WVH0 158 aa24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MROH8Q9H579 483 aa24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CETN3O15182 167 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CETPP11597 493 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAM9Q13443 819 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFIL3Q16649 462 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ODR4Q5SWX8 454 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NYAP1Q6ZVC0 841 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STRA6Q9BX79 667 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTYH3Q9C0H2 523 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLD4Q9HCU8 107 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABHD10Q9NUJ1 306 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAPN11Q9UMQ6 739 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NR2F2P24468 414 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NMT1P30419 496 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACTR2P61160 394 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FSTL1Q12841 308 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYCP1Q15431 976 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 Q3C1V9 767 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC40Q4G0X9 1142 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABHD15Q6UXT9 468 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM59Q8IWR1 403 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.11■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa24.1■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R37O75864 691 aa24.1■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GTF2A2P52657 109 aa24.1■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERVK-9P63128 1117 aa24.1■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERVK-24P63145 666 aa24.1■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SP2Q02086 613 aa24.1■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa24.1■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa24.1■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC26A0AVF1 554 aa24.09■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BACH1O14867 736 aa24.09■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPL13P26373 211 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALCAMQ13740 583 aa24.09■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANO5Q75V66 913 aa24.09■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.09■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.09■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RRAGCQ9HB90 399 aa24.09■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GABBR1Q9UBS5 961 aa24.09■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1W2PQJ5 194 aa24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF862O60290 1169 aa24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STBD1O95210 358 aa24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATG7O95352 703 aa24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TGFB3P10600 412 aa24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT9P35527 623 aa24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCTD2Q14681 263 aa24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGD4Q96M96 766 aa24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DRC1Q96MC2 740 aa24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJC7Q99615 494 aa24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIK3Q9Y2K2 1263 aa24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa24.08■■□□□ 1.45
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASSF10A6NK89 507 aa24.08■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TGFB1I1O43294 461 aa24.08■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USO1O60763 962 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NR3C1P04150 777 aa24.08■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa24.08■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLS3P13797 630 aa24.08■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNA1Q09470 495 aa24.08■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XKR9Q5GH70 373 aa24.08■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FRMD5Q7Z6J6 570 aa24.08■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MMP19Q99542 508 aa24.08■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.07■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMTC1Q8IUR5 882 aa24.07■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.07■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.07■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSCAN12O43309 604 aa24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP2R3AQ06190 1150 aa24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPN14Q15678 1187 aa24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLA2G4FQ68DD2 849 aa24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SWSAP1Q6NVH7 229 aa24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR8K1Q8NGG5 319 aa24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM150BA6NC51 233 aa24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDHXO00330 501 aa24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms