RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599909.1

RPS5-208, Transcript of ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene RPS5, Length 523 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS5-208	ENST00000599909	NCK2	O43639	380 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	ITGB1	P05556	798 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	IER5	Q5VY09	327 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	TMX1	Q9H3N1	280 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	NFASC	O94856	1347 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909		M0QZ92	97 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	SCG2	P13521	617 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	STAT5B	P51692	787 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	NAPA	P54920	295 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	PAK2	Q13177	524 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	ADAM15	Q13444	863 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	APOA5	Q6Q788	366 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	P2RX5	Q93086	422 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	SDF4	Q9BRK5	362 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	ANO3	Q9BYT9	981 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	TMEM260	Q9NX78	707 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	C5orf42	Q9H799	3197 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	MGEA5	O60502	916 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	ATG7	O95352	703 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	CCNE2	O96020	404 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	FUT2	Q10981	343 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	CEP55	Q53EZ4	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	CD207	Q9UJ71	328 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	STXBP3	O00186	592 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	MEIS1	O00470	390 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	STAG3L1	P0CL83	205 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	NDUFV1	P49821	464 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	ADCY7	P51828	1080 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	KRT76	Q01546	638 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	RNF135	Q8IUD6	432 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	POF1B	Q8WVV4	589 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	CLEC1B	Q9P126	229 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	HCST	Q9UBK5	93 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	GINS2	Q9Y248	185 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RPS5-208	ENST00000599909	SMCO2	A6NFE2	343 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	GLP2R	O95838	553 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	KLRC1	P26715	233 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	SREBF1	P36956	1147 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	NRIP1	P48552	1158 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	RTN1	Q16799	776 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	NME8	Q8N427	588 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	EFHB	Q8N7U6	833 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	FBXL18	Q96ME1	805 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	NEK1	Q96PY6	1258 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS5-208	ENST00000599909	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37

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