RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593586.1

TTC9B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

Gene TTC9B, Length 2,323 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-202ENST00000593586 SIPA1L1O43166 1804 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 CES2O00748 559 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 FAM153BP0C7A2 387 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 FAM153CQ494X1 144 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 USH1GQ495M9 461 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 FBXO11Q86XK2 927 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 USP38Q8NB14 1042 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 F5H6K3 240 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 CLSTN1O94985 981 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 KLRC3Q07444 240 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 RPS6KA1Q15418 735 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 NR3C1P04150 777 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 RSPH10BP0C881 870 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 TNNC1P63316 161 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 EPHA7Q15375 998 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 NAGPAQ9UK23 515 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 KCNK3O14649 394 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 MSH4O15457 936 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 NPR1P16066 1061 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 CIITAP33076 1130 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 PRKCIP41743 596 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 CYP4A11Q02928 519 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 IQCKQ8N0W5 287 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 MREGQ8N565 214 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 TMEM59LQ9UK28 342 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 VAV3Q9UKW4 847 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 ASTN1O14525 1302 aa22.04■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 KIF4AO95239 1232 aa22.04■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 MMP14P50281 582 aa22.04■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 CFAP58Q5T655 872 aa22.04■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.04■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.04■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.04■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.04■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.04■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 IDI2Q9BXS1 227 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 GRIN2DO15399 1336 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 RAD51CO43502 376 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 FLOT1O75955 427 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 GCNT3O95395 438 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 NDUFB10O96000 172 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 ANXA13P27216 316 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 CASP4P49662 377 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 CORO7P57737 925 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 GNGT1P63211 74 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 SKOR1P84550 965 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 LRRC57Q8N9N7 239 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 WHAMMQ8TF30 809 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 SLC35C1Q96A29 364 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 GMCL1Q96IK5 515 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 PBKQ96KB5 322 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 SIX2Q9NPC8 291 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 EP400Q96L91 3159 aa22.02■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.02■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 KRT14P02533 472 aa22.02■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.02■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.02■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 GDF11O95390 407 aa22.02■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 EYA4O95677 639 aa22.02■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 GUCY2FP51841 1108 aa22.02■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 JAM2P57087 298 aa22.02■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.02■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 PODNQ7Z5L7 613 aa22.02■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.02■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms