RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 PLCB4Q15147 1175 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 NAALADL2Q58DX5 795 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 WWC2Q6AWC2 1192 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 SGMS1Q86VZ5 419 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 MICU3Q86XE3 530 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP2W1Q8TAV3 490 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 SDF4Q9BRK5 362 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC2Q9BYS8 371 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 IGFLR1Q9H665 355 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 TRPC6Q9Y210 931 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-226ENST00000593200 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC01565O15544 149 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 ITGB1P05556 798 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 STAG3L1P0CL83 205 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJB1P25685 340 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 STAT5BP51692 787 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 PAK2Q13177 524 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAM15Q13444 863 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 NECTIN1Q15223 517 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 CREB3L3Q68CJ9 461 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 TEX2Q8IWB9 1127 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 SPPL3Q8TCT6 385 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 MSLNLQ96KJ4 702 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 TMX1Q9H3N1 280 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 CD207Q9UJ71 328 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 ATG7O95352 703 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 EYA4O95677 639 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 ARP10275 920 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 SCG2P13521 617 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 NDUFV1P49821 464 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC26A2P50443 739 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 NAPAP54920 295 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT76Q01546 638 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 CEP55Q53EZ4 464 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 APOA5Q6Q788 366 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 MTHFD1LQ6UB35 978 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 NME8Q8N427 588 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 KLHL23Q8NBE8 558 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 PGBD1Q96JS3 809 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 ANO3Q9BYT9 981 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNH6Q9H252 994 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 RIC8AQ9NPQ8 531 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 MUTYHQ9UIF7 546 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF318Q5VUA4 2279 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 PIEZO1Q92508 2521 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 EVPLQ92817 2033 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 STXBP3O00186 592 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 MEIS1O00470 390 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 GATMP50440 423 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 FUT2Q10981 343 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM266Q2M3C6 531 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 HFE2Q6ZVN8 426 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF135Q8IUD6 432 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 EFHBQ8N7U6 833 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 SMRP1Q8NCR6 262 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 POF1BQ8WVV4 589 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 ERVK-5Q9HDB9 667 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 CLEC1BQ9P126 229 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 LRFN2Q9ULH4 789 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 TECTAO75443 2155 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 hCG_1984214I3L0E3 225 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 HBP1O60381 514 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 MGEA5O60502 916 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 GLP2RO95838 553 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 CCNE2O96020 404 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 KLRC1P26715 233 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 SREBF1P36956 1147 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 ADCY7P51828 1080 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 NHLH1Q02575 133 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 COASYQ13057 564 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-226ENST00000593200 AP3B2Q13367 1082 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms