RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591964.5

PQLC1-213, Transcript of PQ loop repeat containing 1, human

TSL 3

Gene PQLC1, Length 856 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PQLC1-213	ENST00000591964	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	GRB10	Q13322	594 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	LPIN1	Q14693	890 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	TOP1MT	Q969P6	601 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	ZNF302	Q9NR11	478 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	UPP2	O95045	317 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	IER5	Q5VY09	327 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	KRT40	Q6A162	431 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PQLC1-213	ENST00000591964	WDR81	Q562E7	1941 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	HBP1	O60381	514 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	YME1L1	Q96TA2	773 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	EVPL	Q92817	2033 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964		M0QZ92	97 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	LPXN	O60711	386 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	USP11	P51784	963 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	KRT76	Q01546	638 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	LENG9	Q96B70	501 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	COL1A2	P08123	1366 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	PSAP	P07602	524 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	KLRC1	P26715	233 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	NME8	Q8N427	588 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	ASB2	Q96Q27	587 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	EDIL3	O43854	480 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	CDKL5	O76039	1030 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	ANAPC15	P60006	121 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	BLID	Q8IZY5	108 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	TBCK	Q8TEA7	893 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	SAMM50	Q9Y512	469 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	ATP4A	P20648	1035 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	CD52	P31358	61 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	SCRN1	Q12765	414 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	GALNT17	Q6IS24	598 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	AIFM3	Q96NN9	605 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
PQLC1-213	ENST00000591964	TTC3	P53804	2025 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	ENPP3	O14638	875 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	MSH4	O15457	936 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	SAMD11	Q96NU1	681 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	COL4A6	Q14031	1691 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	WDR64	B1ANS9	1081 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	IL17RA	Q96F46	866 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	RIT2	Q99578	217 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964		M0R2N6	131 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	GAS7	O60861	476 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	ANKRD1	Q15327	319 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	SLC5A5	Q92911	643 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	PFKFB2	O60825	505 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	PAK2	Q13177	524 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	NPY5R	Q15761	445 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	EPC2	Q52LR7	807 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PQLC1-213	ENST00000591964	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		28.73	■■■□□ 2.19

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