RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 PADI3Q9ULW8 664 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC3P53804 2025 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 NFASCO94856 1347 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 M0QZ92 97 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
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CAPNS1-211ENST00000590874 P2RX5Q93086 422 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SDF4Q9BRK5 362 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGB1P05556 798 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 STAT5BP51692 787 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 PAK2Q13177 524 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO7AQ13402 2215 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 GATMP50440 423 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 NAPAP54920 295 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 TMX1Q9H3N1 280 aa29.29■■■□□ 2.28
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CAPNS1-211ENST00000590874 SCG2P13521 617 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM15Q13444 863 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 APOA5Q6Q788 366 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL23Q8NBE8 558 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SPPL3Q8TCT6 385 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
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CAPNS1-211ENST00000590874 ANO2Q9NQ90 1003 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM266Q2M3C6 531 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP55Q53EZ4 464 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 NAALADL2Q58DX5 795 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 MTHFD1LQ6UB35 978 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM260Q9NX78 707 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 CD207Q9UJ71 328 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG7O95352 703 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNE2O96020 404 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 STAG3L1P0CL83 205 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT76Q01546 638 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 FUT2Q10981 343 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R18Q6NYC8 613 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 MUTYHQ9UIF7 546 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1671Q9BY89 1806 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 STXBP3O00186 592 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFV1P49821 464 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ADCY7P51828 1080 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 NME8Q8N427 588 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 POF1BQ8WVV4 589 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 MSLNLQ96KJ4 702 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 TCEANC2Q96MN5 208 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
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CAPNS1-211ENST00000590874 MGEA5O60502 916 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 FOSP01100 380 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC1BQ9P126 229 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 V9GY48 417 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 KLRC1P26715 233 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 SREBF1P36956 1147 aa29.23■■■□□ 2.27
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC26A2P50443 739 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 RTN1Q16799 776 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 HFE2Q6ZVN8 426 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM40Q8WWA1 233 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP2R3CQ969Q6 453 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 CDHR5Q9HBB8 845 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVK-5Q9HDB9 667 aa29.23■■■□□ 2.27
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CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 SMCO2A6NFE2 343 aa29.22■■■□□ 2.27
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CAPNS1-211ENST00000590874 EFHBQ8N7U6 833 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 BACH1O14867 736 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 EYA4O95677 639 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 NRIP1P48552 1158 aa29.21■■■□□ 2.27
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CAPNS1-211ENST00000590874 AP3B2Q13367 1082 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP8B4Q8TF62 1192 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 NEK1Q96PY6 1258 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 BARHL2Q9NY43 387 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-211ENST00000590874 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
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