RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 KBTBD13C9JR72 458 aa20.89■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 DNM1LO00429 736 aa20.89■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 PFKFB1P16118 471 aa20.89■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 PSEN2P49810 448 aa20.89■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHMP4BP1P59074 171 aa20.89■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 PSMC6P62333 389 aa20.89■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLCB4Q15147 1175 aa20.89■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.89■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.89■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM150BA6NC51 233 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 HAS3O00219 553 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 LYPLA2O95372 231 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLCG1P19174 1290 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC26A2P50443 739 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 MFSD10Q14728 455 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 PHF24Q9UPV7 400 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 HPSEQ9Y251 543 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 E9PMD0 336 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC26A4O43511 780 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 OATP04181 439 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 MUTP22033 750 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 MCM4P33991 863 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 NDUFA8P51970 172 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 UBE2HP62256 183 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANO5Q75V66 913 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 KAT6AQ92794 2004 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A1W2PQY0 241 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 YWHABP31946 246 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 XKR3Q5GH77 459 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 NACC1Q96RE7 527 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRPC6Q9Y210 931 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 CABYRO75952 493 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 LIG1P18858 919 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 NPEPPSP55786 919 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 DHX58Q96C10 678 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 ABHD8Q96I13 439 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM167AQ96KS9 214 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 GRIN2DO15399 1336 aa20.85■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 HBP1O60381 514 aa20.85■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 SYKP43405 635 aa20.85■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 E2F4Q16254 413 aa20.85■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 DNM3Q9UQ16 869 aa20.85■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARID2Q68CP9 1835 aa20.85■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 EYA4O95677 639 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 INSRRP14616 1297 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 STAT6P42226 847 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 RARRES1P49788 294 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 MTERF2Q49AM1 385 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 XKR9Q5GH70 373 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-203ENST00000559737 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms