RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559259.1

MFGE8-210, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-210ENST00000559259 GSDMAQ96QA5 445 aa20.25■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 GPR20Q99678 358 aa20.25■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 MTRQ99707 1265 aa20.25■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.25■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.25■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.25■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 PPME1Q9Y570 386 aa20.25■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.24■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 SGPL1O95470 568 aa20.24■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 PLA2G4BP0C869 781 aa20.24■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 AKR1A1P14550 325 aa20.24■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 SMPD1P17405 629 aa20.24■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 TNFAIP2Q03169 654 aa20.24■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 DPYDQ12882 1025 aa20.24■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.24■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.24■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 KCNK18Q7Z418 384 aa20.24■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 SPATA33Q96N06 139 aa20.24■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 MCM3APO60318 1980 aa20.24■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 SLC12A3P55017 1021 aa20.23■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 NKX3-2P78367 333 aa20.23■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.23■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.23■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 BANK1Q8NDB2 785 aa20.23■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 PLIN2Q99541 437 aa20.23■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 TRIM9Q9C026 710 aa20.23■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.23■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF302Q9NR11 478 aa20.23■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 SYCE3A1L190 88 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 E9PMD0 336 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 PPFIA4O75335 1185 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 KCNB1Q14721 858 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 XKR3Q5GH77 459 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 SWSAP1Q6NVH7 229 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 SMARCE1Q969G3 411 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 FAM167AQ96KS9 214 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 TIPINQ9BVW5 301 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 AZI2Q9H6S1 392 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 RMND1Q9NWS8 449 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.22■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 CAVIN2O95810 425 aa20.21■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 CCDC192P0DO97 292 aa20.21■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 YWHABP31946 246 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 AFMP43652 599 aa20.21■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 PNOCQ13519 176 aa20.21■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 MCM6Q14566 821 aa20.21■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.21■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.21■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.21■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.21■□□□□ 0.83
MFGE8-210ENST00000559259 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 A6NJR5 290 aa20.2■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 BACH1O14867 736 aa20.2■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 SEPT4O43236 478 aa20.2■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 STBD1O95210 358 aa20.2■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 STAT5BP51692 787 aa20.2■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 PSMC6P62333 389 aa20.2■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 UGCGQ16739 394 aa20.2■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 COPS5Q92905 334 aa20.2■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 PCYT2Q99447 389 aa20.2■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.2■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF862O60290 1169 aa20.19■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 PRR29P0C7W0 189 aa20.19■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 CYP11B2P19099 503 aa20.19■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 GUCY2CP25092 1073 aa20.19■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 RARRES1P49788 294 aa20.19■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 PRKCEQ02156 737 aa20.19■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 SP4Q02446 784 aa20.19■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.19■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.19■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.19■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.18■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 MYMKA6NI61 221 aa20.18■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
MFGE8-210ENST00000559259 OATP04181 439 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms