RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	KRT32	Q14532	448 aa		18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	POTEB	Q6S5H4	581 aa		18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	GRM6	O15303	877 aa		18.29	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		18.29	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		18.29	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	GJD3	Q8N144	294 aa		18.29	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	NME8	Q8N427	588 aa		18.29	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	PADI3	Q9ULW8	664 aa		18.29	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		18.28	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		18.28	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		18.28	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CDC45	O75419	566 aa		18.28	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	SLC26A2	P50443	739 aa		18.28	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	RCAN1	P53805	252 aa		18.28	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	FGD1	P98174	961 aa		18.28	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	PAK2	Q13177	524 aa		18.28	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	COL19A1	Q14993	1142 aa		18.28	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		18.28	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		18.28	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		18.28	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CLDND1	Q9NY35	253 aa		18.28	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	MYO7A	Q13402	2215 aa		18.28	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		18.27	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		18.27	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	BACH1	O14867	736 aa		18.27	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	NCK2	O43639	380 aa		18.27	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	HBP1	O60381	514 aa		18.27	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	GPR37L1	O60883	481 aa		18.27	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CCNE2	O96020	404 aa		18.27	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	KLRC1	P26715	233 aa		18.27	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	KRT76	Q01546	638 aa		18.27	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		18.27	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		18.27	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		18.27	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	PLVAP	Q9BX97	442 aa		18.27	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		18.26	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		18.26	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	FAM86B1	E9PN63	330 aa		18.26	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		18.26	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	STAG3L1	P0CL83	205 aa		18.26	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CPA1	P15085	419 aa		18.26	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	18.26	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	APOBR	Q0VD83	1088 aa		18.26	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		18.26	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	FAM122A	Q96E09	287 aa		18.26	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		18.26	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF302	Q9NR11	478 aa		18.26	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	FAM50B	Q9Y247	325 aa		18.26	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CSPG5	O95196	566 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CYP3A4	P08684	503 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	SCG2	P13521	617 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	LTBR	P36941	435 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	PLA2G5	P39877	138 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	HYAL1	Q12794	435 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777		Q6ZUG5	572 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	P2RX5	Q93086	422 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	UIMC1	Q96RL1	719 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	GINS2	Q9Y248	185 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	EVPL	Q92817	2033 aa		18.25	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ESYT2	A0FGR8	921 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ADAMTS3	O15072	1205 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	MMP1	P03956	469 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	MCTP2	Q6DN12	878 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DDX11-222	ENST00000542777	TMX1	Q9H3N1	280 aa		18.24	■□□□□ 0.51

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