RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 CTNNB1P35222 781 aa27.36■■□□□ 1.97
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ACER3-211ENST00000531461 LINC01599Q8WXQ3 324 aa27.36■■□□□ 1.97
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ACER3-211ENST00000531461 PLVAPQ9BX97 442 aa27.36■■□□□ 1.97
ACER3-211ENST00000531461 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
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ACER3-211ENST00000531461 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.978e-6■■■□□ 18.5
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ACER3-211ENST00000531461 COL1A2P08123 1366 aa27.33■■□□□ 1.97
ACER3-211ENST00000531461 EVPLQ92817 2033 aa27.33■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa27.32■■□□□ 1.96
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ACER3-211ENST00000531461 GPR37L1O60883 481 aa27.32■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 FAM86B2P0C5J1 330 aa27.32■■□□□ 1.96
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ACER3-211ENST00000531461 ADD1P35611 737 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
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ACER3-211ENST00000531461 STAG3L1P0CL83 205 aa27.3■■□□□ 1.96
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ACER3-211ENST00000531461 TMEM62Q0P6H9 643 aa27.3■■□□□ 1.96
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ACER3-211ENST00000531461 WDR81Q562E7 1941 aa27.29■■□□□ 1.96
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ACER3-211ENST00000531461 KLRC1P26715 233 aa27.29■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 SETQ01105 290 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 ZNF484Q5JVG2 852 aa27.29■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa27.29■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa27.29■■□□□ 1.96
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ACER3-211ENST00000531461 C11orf16Q9NQ32 467 aa27.29■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 ZNF302Q9NR11 478 aa27.29■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 TBC1D22BQ9NU19 505 aa27.29■■□□□ 1.96
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ACER3-211ENST00000531461 HSPA4P34932 840 aa27.28■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 LTBRP36941 435 aa27.28■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 APOBRQ0VD83 1088 aa27.28■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 PKN1Q16512 942 aa27.28■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 Q6ZUG5 572 aa27.28■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 TMX1Q9H3N1 280 aa27.28■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 C6orf50Q9HD87 102 aa27.28■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 PRKAG3Q9UGI9 489 aa27.28■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 PLAGL2Q9UPG8 496 aa27.28■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 ZBTB42B2RXF5 422 aa27.27■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 GNA11P29992 359 aa27.27■■□□□ 1.96
ACER3-211ENST00000531461 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
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