RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529953.5

BBS1-217, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 4

Gene BBS1, Length 604 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-217	ENST00000529953	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	NLRX1	Q86UT6	975 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	EFHB	Q8N7U6	833 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	PRSS33	Q8NF86	280 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	EDA	Q92838	391 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	CD207	Q9UJ71	328 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	TECTA	O75443	2155 aa		12.83	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	STXBP3	O00186	592 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	ZBTB43	O43298	467 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	INSRR	P14616	1297 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	COASY	Q13057	564 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	FBXL16	Q8N461	479 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	PHOX2B	Q99453	314 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	MYL10	Q9BUA6	226 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	TMX1	Q9H3N1	280 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	MARK3	P27448	753 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	HSPA4	P34932	840 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	GATM	P50440	423 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	IER5L	Q5T953	404 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	RSPH3	Q86UC2	560 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	IGFLR1	Q9H665	355 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	JADE2	Q9NQC1	790 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	PADI3	Q9ULW8	664 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	KCNC3	Q14003	757 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	PLCB4	Q15147	1175 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	ANKRD1	Q15327	319 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	RTN1	Q16799	776 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	FANCB	Q8NB91	859 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	POF1B	Q8WVV4	589 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	SUSD6	Q92537	303 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	MAFG	O15525	162 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	MGEA5	O60502	916 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	ATG7	O95352	703 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	ANAPC15	P60006	121 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	ZXDA	P98168	799 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	TCF15	Q12870	199 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	MTMR1	Q13613	665 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	UBE2S	Q16763	222 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	APOA5	Q6Q788	366 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	MICU3	Q86XE3	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	BICD2	Q8TD16	824 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	GLG1	Q92896	1179 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	KCNB2	Q92953	911 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	TMEM221	A6NGB7	291 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953		M0R296	226 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	CDKL5	O76039	1030 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	CSPG5	O95196	566 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	SCG2	P13521	617 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	NRIP1	P48552	1158 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	NDUFV1	P49821	464 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	IGBP1	P78318	339 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BBS1-217	ENST00000529953	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36

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