RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SWSAP1Q6NVH7 229 aa26.47■■□□□ 1.83
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOP1MTQ969P6 601 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 M0QZ92 97 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DEXIO95424 95 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERVK-21P61565 698 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 YME1L1Q96TA2 773 aa26.46■■□□□ 1.83
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM62Q0P6H9 643 aa26.45■■□□□ 1.82
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTHFD1LQ6UB35 978 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SIP14410 1827 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLRC1P26715 233 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP8B4Q8TF62 1192 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GDPD5Q8WTR4 605 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUGCTQ9HAC7 445 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCDHA4Q9UN74 947 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SAMM50Q9Y512 469 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRPV2Q9Y5S1 764 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LPXNO60711 386 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSAPP07602 524 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP11P51784 963 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRT76Q01546 638 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF484Q5JVG2 852 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BLIDQ8IZY5 108 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NME8Q8N427 588 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASB2Q96Q27 587 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C17orf80Q9BSJ5 609 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ENPP3O14638 875 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD52P31358 61 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL27Q8NEV9 243 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBXO22Q8NEZ5 403 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TBCKQ8TEA7 893 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LENG9Q96B70 501 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AIFM3Q96NN9 605 aa26.41■■□□□ 1.82
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANAPC15P60006 121 aa26.4■■□□□ 1.82
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL1A2P08123 1366 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa26.39■■□□□ 1.82
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 EDIL3O43854 480 aa26.39■■□□□ 1.82
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 GINS2Q9Y248 185 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EVPLQ92817 2033 aa26.38■■□□□ 1.81
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 REV3LO60673 3130 aa26.38■■□□□ 1.81
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DAGLBQ8NCG7 672 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TEKT3Q9BXF9 490 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FTHL17Q9BXU8 183 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DISC1Q9NRI5 854 aa26.37■■□□□ 1.81
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBTB42B2RXF5 422 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHMP2AO43633 222 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PFKFB2O60825 505 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TFF2Q03403 129 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AAK1Q2M2I8 961 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FIBCD1Q8N539 461 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC5A5Q92911 643 aa26.36■■□□□ 1.81
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