RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498448.1

C1orf109-212, Transcript of chromosome 1 open reading frame 109, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf109, Length 747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109-212ENST00000498448 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.48■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.48■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 TDHQ8IZJ6 230 aa20.48■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 WNT8AQ9H1J5 351 aa20.48■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 IL23AQ9NPF7 189 aa20.48■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.48■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 LAD1O00515 517 aa20.47■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 OATP04181 439 aa20.47■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 ATP4AP20648 1035 aa20.47■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 SYT1P21579 422 aa20.47■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 THPOP40225 353 aa20.47■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.47■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 XKR3Q5GH77 459 aa20.47■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 RPAINQ86UA6 219 aa20.47■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 NEK9Q8TD19 979 aa20.47■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 SCLYQ96I15 445 aa20.47■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.47■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.47■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 EML1O00423 815 aa20.46■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 PRKCEQ02156 737 aa20.46■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.46■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
C1orf109-212ENST00000498448 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.45■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 MAGEB2O15479 319 aa20.45■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 ZNF862O60290 1169 aa20.45■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 FGBP02675 491 aa20.45■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 RSPH10BP0C881 870 aa20.45■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 KLRC1P26715 233 aa20.45■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.45■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.45■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.45■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 NME8Q8N427 588 aa20.45■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 RAB34Q9BZG1 259 aa20.45■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.45■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.45■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.45■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 STK24Q9Y6E0 443 aa20.45■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa20.44■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 ACTN1P12814 892 aa20.44■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 PTGDRQ13258 359 aa20.44■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 UGCGQ16739 394 aa20.44■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 BANK1Q8NDB2 785 aa20.44■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 ERMNQ8TAM6 284 aa20.44■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 WNT8BQ93098 351 aa20.44■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 LTBP2Q14767 1821 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 M0QZ92 97 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 STX6O43752 255 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 BMP15O95972 392 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 TMOD1P28289 359 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 PRPHP41219 470 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 TECP42680 631 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 EPHB4P54760 987 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 BECN1Q14457 450 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 NBR1Q14596 966 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 SHHQ15465 462 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 TMEM240Q5SV17 173 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 IER5Q5VY09 327 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 ZNF365Q70YC5 407 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 C4orf19Q8IY42 314 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 PPME1Q9Y570 386 aa20.43■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 ACRP10323 421 aa20.42■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 PDIA5Q14554 519 aa20.42■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 FAM26DQ5JW98 314 aa20.42■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.42■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.42■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 DYDC2Q96IM9 177 aa20.42■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 LXNQ9BS40 222 aa20.42■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.41■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 SLITRK3O94933 977 aa20.41■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 C22orf31O95567 290 aa20.41■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.41■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.41■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.41■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.41■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.41■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 FERMT3Q86UX7 667 aa20.41■□□□□ 0.86
C1orf109-212ENST00000498448 TPH2Q8IWU9 490 aa20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms