RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 LGALS16A8MUM7 142 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 K7ERI5 159 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 GAP43P17677 238 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 PMS1P54277 932 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 PSMD2Q13200 908 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 GPRC5CQ9NQ84 441 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 TFR2Q9UP52 801 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 USTQ9Y2C2 406 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 DENND3A2RUS2 1198 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 SPOPO43791 374 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 CEP104O60308 925 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 RHOBTB3O94955 611 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 BCRP11274 1271 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 NEFHP12036 1026 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 THNSL1Q8IYQ7 743 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC51Q96ER9 411 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 NOX5Q96PH1 765 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 PNMA2Q9UL42 364 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 ICAM1P05362 532 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 YWHABP31946 246 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 NCAPHQ15003 741 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC50Q8IVM0 306 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 KLHL7Q8IXQ5 586 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 GLIS3Q8NEA6 775 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM143Q96AN5 459 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 ACCSQ96QU6 501 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 IWS1Q96ST2 819 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 MXRA8Q9BRK3 442 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 ERLIN2O94905 339 aa10.52□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 NDUFA10O95299 355 aa10.52□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 EPHA7Q15375 998 aa10.52□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 MUM1L1Q5H9M0 696 aa10.52□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 CEP112Q8N8E3 955 aa10.52□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 RPA1P27694 616 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 EPHX2P34913 555 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 JAG1P78504 1218 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 MYL7Q01449 175 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 PLCB3Q01970 1234 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 SESTD1Q86VW0 696 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 C7orf25Q9BPX7 421 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 RUSC1Q9BVN2 902 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 ABHD10Q9NUJ1 306 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 LRRC53A6NM62 1247 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 C19orf81C9J6K1 198 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 NFKBIEO00221 500 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 EYA4O95677 639 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 GGPS1O95749 300 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 CETN2P41208 172 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 SOX10P56693 466 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 ZBED6P86452 979 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 EHHADHQ08426 723 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNB1Q14721 858 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 NAA35Q5VZE5 725 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM160B1Q5W0V3 765 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 PAF1Q8N7H5 531 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 ERO1AQ96HE7 468 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 UNC45AQ9H3U1 944 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 ST7Q9NRC1 585 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 MEIS2O14770 477 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 ZMYND10O75800 440 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 ACTN1P12814 892 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 CYP11B2P19099 503 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 KRT76Q01546 638 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC35G1Q2M3R5 365 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF394Q53GI3 561 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 USP20Q9Y2K6 914 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 LTBP4Q8N2S1 1624 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 IQCA1LA6NCM1 817 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 EML1O00423 815 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 ZEB2O60315 1214 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 PSMC5P62195 406 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 HAUS6Q7Z4H7 955 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms