RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 SPDYE5A6NIY4 337 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ZW10O43264 779 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PPIP5K2O43314 1243 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GHRP10912 638 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 VEPH1Q14D04 833 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ADCK5Q3MIX3 580 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC81Q6ZN84 652 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RASSF5Q8WWW0 418 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 FAM149B1Q96BN6 582 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 AP1M1Q9BXS5 423 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SNX25Q9H3E2 840 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 I3L4J1 428 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 MAPK13O15264 365 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 NCAM2O15394 837 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL41O60662 606 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ADCY8P40145 1251 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PLCB3Q01970 1234 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RNF220Q5VTB9 566 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CDKL2Q92772 493 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DESI2Q9BSY9 194 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TEX12Q9BXU0 123 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 VPS16Q9H269 839 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 KIF17Q9P2E2 1029 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DOLKQ9UPQ8 538 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 UBN2Q6ZU65 1347 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0G2JS52 829 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RASA4BC9J798 803 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 H7C0C1 242 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF18P17022 549 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ITGALP20701 1170 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PPP2R1AP30153 589 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 HAND2P61296 217 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CSNK2BP67870 215 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CCNG2Q16589 344 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM266Q2M3C6 531 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 BORAQ6PGQ7 559 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 NYAP1Q6ZVC0 841 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RHOT2Q8IXI1 618 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SPARTQ8N0X7 666 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CNTROBQ8N137 903 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TTC13Q8NBP0 860 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 VPS39Q96JC1 886 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF285Q96NJ3 590 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 FOXP3Q9BZS1 431 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SNX6Q9UNH7 406 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CRYZL1O95825 349 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CLPTM1O96005 669 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 MYCP01106 439 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF76P36508 570 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SPAG1Q07617 926 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 STX5Q13190 355 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CLEC4GQ6UXB4 293 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TMTC3Q6ZXV5 915 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC103Q8IW40 242 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 AGAP11Q8TF27 550 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RNF38Q9H0F5 515 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SP140LQ9H930 580 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJC11Q9NVH1 559 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 HYOU1Q9Y4L1 999 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GW55 424 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ZBBXA8MT70 800 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 FAM25EA8MYX2 175 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CCRL2O00421 344 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 AREL1O15033 823 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GYG2O15488 501 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GAS7O60861 476 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ITGA2BP08514 1039 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DUX4L2P0CJ85 424 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DUX4L3P0CJ86 424 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DUX4L4P0CJ87 422 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DUX4L5P0CJ88 424 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DUX4L6P0CJ89 424 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DUX4L7P0CJ90 424 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms