RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433909.2

CCDC189-201, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC189, Length 1,157 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-201ENST00000433909 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 UIMC1Q96RL1 719 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 C6orf50Q9HD87 102 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 SQORQ9Y6N5 450 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 ESYT2A0FGR8 921 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 CYP3A4P08684 503 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 ZNF302Q9NR11 478 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 HBP1O60381 514 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 RB1P06400 928 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 BMPR1AP36894 532 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 KRT76Q01546 638 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 PAK2Q13177 524 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 PKN1Q16512 942 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 MCTP2Q6DN12 878 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 NME8Q8N427 588 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 PHKBQ93100 1093 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 PADI3Q9ULW8 664 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 TTC3P53804 2025 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 NID2Q14112 1375 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 ADAMTS3O15072 1205 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 DGKIO75912 1065 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 LINC00271P0C7V0 271 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 RPS6KB1P23443 525 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 KLRC1P26715 233 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 GNA11P29992 359 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 PPFIA3O75145 1194 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 GINS2Q9Y248 185 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC189-201ENST00000433909 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 GRM6O15303 877 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 PSMA5P28066 241 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 FBXL16Q8N461 479 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 NEK9Q8TD19 979 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 COL1A2P08123 1366 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 REC8O95072 547 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 STAG3L1P0CL83 205 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 IL9P15248 144 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 PRR16Q569H4 304 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 BICD2Q8TD16 824 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC189-201ENST00000433909 CSPG5O95196 566 aa22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms