RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 SARAFQ96BY9 339 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARMC5Q96C12 935 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 HES6Q96HZ4 224 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 VCPIP1Q96JH7 1222 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 RHOVQ96L33 236 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 UROC1Q96N76 676 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 PYGO2Q9BRQ0 406 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTA3Q9BTC8 594 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 VPS16Q9H269 839 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHST7Q9NS84 486 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASB6Q9NWX5 421 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZIM2Q9NZV7 527 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAM30Q9UKF2 790 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 ICAM5Q9UMF0 924 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 NTNG1Q9Y2I2 539 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 RWDD3Q9Y3V2 267 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAST3O60307 1309 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM129A0AVI4 362 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC01548A6NM66 108 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 LACTBL1A8MY62 500 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM24O15164 1050 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 SGSM2O43147 1006 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBC1D8O95759 1140 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAH10OSP0CZ25 163 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 GYPEP15421 78 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 EPHB2P29323 1055 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTSKP43235 329 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZXDBP98169 803 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRM1Q13255 1194 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 RABEP1Q15276 862 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC41Q15345 812 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 FCN2Q15485 313 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBR1Q16650 682 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIK3R6Q5UE93 754 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAM5Q6NVV9 412 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 DTHD1Q6ZMT9 781 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 RGS22Q8NE09 1264 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHCBP1Q8NEM2 672 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 CPT1CQ8TCG5 803 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEC14L1Q92503 715 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 MNTQ99583 582 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC46A2Q9BY10 475 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 EHMT1Q9H9B1 1298 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 DTLQ9NZJ0 730 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 SELENONQ9NZV5 590 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 DKK2Q9UBU2 259 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAK1Q9UPV9 953 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRR36Q9H6K5 1346 aa-0.1□□□□□ -2.42
RNU6-172P-201ENST00000411000 A8MU10 97 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC26A4O43511 780 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXO21O94952 628 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 NTRK1P04629 796 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 GSTM1P09488 218 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLD1P28340 1107 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 YARSP54577 528 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDE4BQ07343 736 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCEA2Q15560 299 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 AKNAD1Q5T1N1 836 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 FCRLBQ6BAA4 426 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 LVRNQ6Q4G3 990 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEPPQ6URK8 271 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRTC3Q6UUV7 619 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP30Q70CQ3 517 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLITRK4Q8IW52 837 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC44A3Q8N4M1 653 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM13CQ8NE31 585 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 DDRGK1Q96HY6 314 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDLIM2Q96JY6 352 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 MEIS3Q99687 375 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 SH2D3AQ9BRG2 576 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALG2Q9H553 416 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLIP2Q9UDT6 1046 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP8B1Q9UNU6 501 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 MINPP1Q9UNW1 487 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 SORCS3Q9UPU3 1222 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 WASF3Q9UPY6 502 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 FSIP2Q5CZC0 6907 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 SSPOA2VEC9 5147 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARID3CA6NKF2 412 aa-0.11□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms