RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410938.1

RNU6-1328P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1328, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1328P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1328P-201ENST00000410938 BCL6P41182 706 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IL12RB1P42701 662 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 JAM2P57087 298 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GPSM2P81274 684 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PPFIA1Q13136 1202 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NFKBIBQ15653 356 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CYP27C1Q4G0S4 372 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ANO6Q4KMQ2 910 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PRRT3Q5FWE3 981 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CT83Q5H943 113 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HYIQ5T013 277 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PAOXQ6QHF9 649 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IGF2-ASQ6U949 168 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 B3GNT9Q6UX72 402 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C20orf204Q6ZNR8 217 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OTOP1Q7RTM1 612 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 UBE3DQ7Z6J8 389 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CABP7Q86V35 215 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FBXO11Q86XK2 927 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SIRT2Q8IXJ6 389 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CMIPQ8IY22 773 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CRIPAKQ8N1N5 446 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OXR1Q8N573 874 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DTWD2Q8NBA8 298 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PPP1R35Q8TAP8 253 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FBLIM1Q8WUP2 373 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RUBCNQ92622 972 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GCC1Q96CN9 775 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 VWCEQ96DN2 955 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TCTN2Q96GX1 697 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PTCHD1Q96NR3 888 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC2A13Q96QE2 648 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ADI1Q9BV57 179 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 UNC45AQ9H3U1 944 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF287Q9HBT7 754 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 STARD7Q9NQZ5 370 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SMC4Q9NTJ3 1288 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RIC8BQ9NVN3 520 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TCFL5Q9UL49 500 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CBLCQ9ULV8 474 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PADI4Q9UM07 663 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PTPN22Q9Y2R2 807 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 STARD13Q9Y3M8 1113 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 A0A1W2PPL8 197 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PRAMEF25A6NGN4 478 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RASA4BC9J798 803 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FZD9O00144 591 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 WNT9AO14904 365 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KPNA5O15131 536 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ST8SIA5O15466 376 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RASA4O43374 803 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 AGR2O95994 175 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FTLP02792 175 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CLEC2LP0C7M8 214 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TNFAIP3P21580 790 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C5AR1P21730 350 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TNFSF4P23510 183 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RPL10P27635 214 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NTF4P34130 210 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GJA4P35212 333 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 COPB2P35606 906 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PPM1AP35813 382 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CDK17Q00537 523 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NUCB1Q02818 461 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DUSP4Q13115 394 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SEMA5AQ13591 1074 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PRKG1Q13976 671 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SPIDRQ14159 915 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LAPTM4AQ15012 233 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FAM209BQ5JX69 171 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IZUMO3Q5VZ72 239 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GGT6Q6P531 493 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms