RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 CDHR1Q96JP9 859 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 THAP9Q9H5L6 903 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 PYCARDQ9ULZ3 195 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 NFASCO94856 1347 aa17.03■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 HOXD13P35453 343 aa17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R2P41236 205 aa17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 COPB1P53618 953 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 NPEPPSP55786 919 aa17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ACTR2P61160 394 aa17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 PSMC5P62195 406 aa17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 PLA2G4FQ68DD2 849 aa17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ABHD15Q6UXT9 468 aa17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC8AQ8IWT6 810 aa17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 C4orf19Q8IY42 314 aa17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MYCT1Q8N699 235 aa17.02■□□□□ 0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF862O60290 1169 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 LYPLA2O95372 231 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 TPM3P06753 285 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 MSNP26038 577 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 NMT1P30419 496 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 COPB2P35606 906 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 RARRES1P49788 294 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 LY6KQ17RY6 165 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM63BQ5T3F8 832 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 ARMCX5Q6P1M9 558 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 SHCBP1Q8NEM2 672 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 IMPACTQ9P2X3 320 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 BACH1O14867 736 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 TBCAO75347 108 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 FAM13AO94988 1023 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 STBD1O95210 358 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 KCNA1Q09470 495 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 ANO5Q75V66 913 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 RASAL3Q86YV0 1011 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 DAW1Q8N136 415 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 CTAGE1Q96RT6 745 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 KCTD10Q9H3F6 313 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 DOCK3Q8IZD9 2030 aa17.01■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa17■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 N4BP3O15049 544 aa17■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 HIP1RO75146 1068 aa17■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 ARIH2O95376 493 aa17■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 XKR9Q5GH70 373 aa17■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 SAPCD2Q86UD0 394 aa17■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 KSR1Q8IVT5 923 aa17■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 IKZF4Q9H2S9 585 aa17■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC37A2A6NM11 1700 aa17■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 PLXNB2O15031 1838 aa17■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 PSAPP07602 524 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 CCNA1P78396 465 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 MAPK7Q13164 816 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 ZCWPW2Q504Y3 356 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 RDM1Q8NG50 284 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 FIZ1Q96SL8 496 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 PARVGQ9HBI0 331 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 PDGFCQ9NRA1 345 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 USO1O60763 962 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 GCNT3O95395 438 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 GUCY2CP25092 1073 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 ADORA2AP29274 412 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 PBX1P40424 430 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 SPAG1Q07617 926 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 FILIP1LQ4L180 1135 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 CEP135Q66GS9 1140 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 CPA4Q9UI42 421 aa16.99■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 PASKQ96RG2 1323 aa16.98■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa16.98■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 ATG7O95352 703 aa16.98■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 GAP43P17677 238 aa16.98■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 ATP4AP20648 1035 aa16.98■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF131P52739 623 aa16.98■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC63Q05C16 580 aa16.98■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF792Q3KQV3 632 aa16.98■□□□□ 0.31
CASQ1-201ENST00000368078 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms