RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 IER2Q9BTL4 223 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 CD244Q9BZW8 370 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 ADCY8P40145 1251 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 SLC25A3Q00325 362 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC142Q17RM4 750 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 KIZQ2M2Z5 673 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 NELFAQ9H3P2 528 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 CAPN14A8MX76 684 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 PEX11BO96011 259 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 D2HGDHQ8N465 521 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PQU0 124 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 HHEXQ03014 270 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 HGFACQ04756 655 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 FSTL1Q12841 308 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 PCOLCEQ15113 449 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 DDAH1O94760 285 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 PROZP22891 400 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 NTRK3Q16288 839 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-202ENST00000367364 SOD2P04179 222 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 STILQ15468 1287 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 CSRP2Q16527 193 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 OR10A2Q9H208 303 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 FBXO10Q9UK96 956 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 MRE11P49959 708 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 GPR150Q8NGU9 434 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 DCAF4Q8WV16 495 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 IPPKQ9H8X2 491 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 CYP27B1O15528 508 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 SLC26A4O43511 780 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 PTGS1P23219 599 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 VAMP1P23763 118 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 GPR85P60893 370 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 CRHR2Q13324 411 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 WNK4Q96J92 1243 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 EPN3Q9H201 632 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 INCENPQ9NQS7 918 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 RPS6KA4O75676 772 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 GJB6O95452 261 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 MC4RP32245 332 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 SCNN1GP51170 649 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 TNNI3KQ59H18 835 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 GALNT8Q9NY28 637 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 Q6ZRM9 215 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 BTBD7Q9P203 1132 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 AGRPO00253 132 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 MPIG6BO95866 241 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 AOAHP28039 575 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 CD83Q01151 205 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 FXNQ16595 210 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 KANK2Q63ZY3 851 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 STYK1Q6J9G0 422 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 MRGPREQ86SM8 312 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-202ENST00000367364 A0A0G2JNJ9 132 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 BLACEA4D250 179 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 MEOX1P50221 254 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP10-11P60412 298 aa6.83□□□□□ -1.32
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