RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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SPNS1-204ENST00000352260 MEIS1O00470 390 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 PSMD10O75832 226 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 ERLIN2O94905 339 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 PSMC6P62333 389 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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SPNS1-204ENST00000352260 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.5■□□□□ 0.87
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SPNS1-204ENST00000352260 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 ZBED4O75132 1171 aa20.49■□□□□ 0.87
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SPNS1-204ENST00000352260 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 C12orf42Q96LP6 360 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 DNM3Q9UQ16 869 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.49■□□□□ 0.87
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SPNS1-204ENST00000352260 ARP10275 920 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 PPP2R5CQ13362 524 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 ARSHQ5FYA8 562 aa20.49■□□□□ 0.87
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SPNS1-204ENST00000352260 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.49■□□□□ 0.87
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SPNS1-204ENST00000352260 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.49■□□□□ 0.87
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SPNS1-204ENST00000352260 ATG4CQ96DT6 458 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.49■□□□□ 0.87
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SPNS1-204ENST00000352260 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 PARP14Q460N5 1801 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 LGALS16A8MUM7 142 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 FDX1P10109 184 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 CYP4A11Q02928 519 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC41Q15345 812 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 VWA5AO00534 786 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGAP25P42331 645 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 HMGCS2P54868 508 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.872e-8■■■□□ 16.4
SPNS1-204ENST00000352260 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.47■□□□□ 0.87
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SPNS1-204ENST00000352260 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 GAS7O60861 476 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 UBXN1Q04323 297 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 PPFIA1Q13136 1202 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.47■□□□□ 0.87
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SPNS1-204ENST00000352260 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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SPNS1-204ENST00000352260 C19orf81C9J6K1 198 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 CHMP2AO43633 222 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 PHACTR2O75167 634 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 GYPCP04921 128 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.46■□□□□ 0.87
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SPNS1-204ENST00000352260 MB21D1Q8N884 522 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.46■□□□□ 0.87
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SPNS1-204ENST00000352260 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS1-204ENST00000352260 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 EYA4O95677 639 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 ITGB5P18084 799 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC63Q05C16 580 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 PRKG1Q13976 671 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 IQCEQ6IPM2 695 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS1-204ENST00000352260 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.45■□□□□ 0.86
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