RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

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Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 PARVGQ9HBI0 331 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 CLCN6P51797 869 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 USP14P54578 494 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 CHMP4BP1P59074 171 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 AMPD2Q01433 879 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 APBA1Q02410 837 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 TKFCQ3LXA3 575 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 DCAF15Q66K64 600 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 CEP112Q8N8E3 955 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 DEF6Q9H4E7 631 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ZNF446Q9NWS9 450 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 DUSP10Q9Y6W6 482 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 AKAP3O75969 853 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 EPS15P42566 896 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 DOCK1Q14185 1865 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ZBED4O75132 1171 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 LCA5LO95447 670 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ZNF131P52739 623 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 MIER3Q7Z3K6 550 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 RABGGTAQ92696 567 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 KCND2Q9NZV8 630 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 TGFB1I1O43294 461 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 AKR1B10O60218 316 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 RPL13P26373 211 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 BACE1P56817 501 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 KIF5AQ12840 1032 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 HGSNATQ68CP4 663 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 NEK9Q8TD19 979 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 WNK4Q96J92 1243 aa25.16■■□□□ 1.62
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SNX18-201ENST00000326277 FIZ1Q96SL8 496 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 JADE2Q9NQC1 790 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 MYO6Q9UM54 1294 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 FZD1Q9UP38 647 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.16■■□□□ 1.62
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SNX18-201ENST00000326277 ENC1O14682 589 aa25.15■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 CLIC2O15247 247 aa25.15■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 CASP4P49662 377 aa25.15■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ATG4CQ96DT6 458 aa25.15■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.15■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 WRNIP1Q96S55 665 aa25.15■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 IKZF4Q9H2S9 585 aa25.15■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 CBX1P83916 185 aa25.14■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 MTMR1Q13613 665 aa25.14■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa25.14■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 TSGA10Q9BZW7 698 aa25.14■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 SEL1LQ9UBV2 794 aa25.14■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ODF2LQ9ULJ1 636 aa25.14■■□□□ 1.62
SNX18-201ENST00000326277 ARHGEF35A5YM69 484 aa25.14■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 TLR2O60603 784 aa25.14■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 PTPRAP18433 802 aa25.14■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 PGM5Q15124 567 aa25.14■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 SFMBT2Q5VUG0 894 aa25.14■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.14■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 GANQ9H2C0 597 aa25.14■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 MACROD2A1Z1Q3 448 aa25.13■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 AFPP02771 609 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 ZNF720Q7Z2F6 126 aa25.13■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.13■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 KSR1Q8IVT5 923 aa25.13■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 FAM178BQ8IXR5 827 aa25.13■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.13■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 FBXO41Q8TF61 875 aa25.13■■□□□ 1.61
SNX18-201ENST00000326277 PICK1Q9NRD5 415 aa25.13■■□□□ 1.61
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