RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288616.7

CABP1-201, Transcript of calcium binding protein 1, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CABP1, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1-201ENST00000288616 C5orf42Q9H799 3197 aa20.2■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 ITGB1P05556 798 aa20.2■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 ARP10275 920 aa20.2■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 LIFRP42702 1097 aa20.2■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 STAT5BP51692 787 aa20.2■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 ACTR2P61160 394 aa20.2■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 PAK2Q13177 524 aa20.2■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.2■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.2■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.2■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.2■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 SDF4Q9BRK5 362 aa20.2■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.2■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 CD207Q9UJ71 328 aa20.2■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.19■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 PPFIA3O75145 1194 aa20.19■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 STAG3L1P0CL83 205 aa20.19■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 NDUFV1P49821 464 aa20.19■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 ADAM15Q13444 863 aa20.19■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.19■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.19■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.19■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 MUTYHQ9UIF7 546 aa20.19■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.19■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 GINS2Q9Y248 185 aa20.19■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.19■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 STXBP3O00186 592 aa20.18■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 SCG2P13521 617 aa20.18■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 NAPAP54920 295 aa20.18■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.18■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 POF1BQ8WVV4 589 aa20.18■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 P2RX5Q93086 422 aa20.18■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 KRT76Q01546 638 aa20.17■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.17■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.17■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.17■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.17■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.17■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 RNF135Q8IUD6 432 aa20.17■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.17■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.17■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 TMX1Q9H3N1 280 aa20.17■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 TMEM260Q9NX78 707 aa20.17■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.17■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 SQORQ9Y6N5 450 aa20.17■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.17■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 EVPLQ92817 2033 aa20.16■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 NRIP1P48552 1158 aa20.16■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 FBXL18Q96ME1 805 aa20.16■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.16■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.16■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 ANO3Q9BYT9 981 aa20.16■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.16■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 NFASCO94856 1347 aa20.16■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa20.15■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 BACH1O14867 736 aa20.15■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 KLRC1P26715 233 aa20.15■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 ZNF76P36508 570 aa20.15■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 ADCY7P51828 1080 aa20.15■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 NECTIN1Q15223 517 aa20.15■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 CEP55Q53EZ4 464 aa20.15■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.15■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.15■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.15■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.15■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.15■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.15■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.15■□□□□ 0.82
CABP1-201ENST00000288616 SMCO2A6NFE2 343 aa20.14■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 MGEA5O60502 916 aa20.14■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.14■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 NME8Q8N427 588 aa20.14■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.14■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 CLEC1BQ9P126 229 aa20.14■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20.13■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.13■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 CCNE2O96020 404 aa20.13■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 NHLH1Q02575 133 aa20.13■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 APOA5Q6Q788 366 aa20.13■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 EFHBQ8N7U6 833 aa20.13■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 TECTAO75443 2155 aa20.13■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 ZNF318Q5VUA4 2279 aa20.12■□□□□ 0.81
CABP1-201ENST00000288616 MEIS1O00470 390 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms