RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249501.4

HOXD10-201, Transcript of homeobox D10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD10, Length 1,989 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-201ENST00000249501 SCFD1Q8WVM8 642 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 LYPLA2O95372 231 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 YWHABP31946 246 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 RARRES1P49788 294 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 SPAG1Q07617 926 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 C4orf19Q8IY42 314 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 RDM1Q8NG50 284 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 VPS16Q9H269 839 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 GABBR1Q9UBS5 961 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 FAM13AO94988 1023 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 COPB1P53618 953 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 ACTR2P61160 394 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 PADI6Q6TGC4 694 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 MYBP10242 640 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 CCNA1P78396 465 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 SWSAP1Q6NVH7 229 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 MYCT1Q8N699 235 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 ARID2Q68CP9 1835 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 BACH1O14867 736 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 ZNF862O60290 1169 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 HIP1RO75146 1068 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 PSAPP07602 524 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 NPEPPSP55786 919 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 LRRC8AQ8IWT6 810 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 KCND2Q9NZV8 630 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 B4DLN1 442 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 N4BP3O15049 544 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 GAP43P17677 238 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 GUCY2CP25092 1073 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 LRRC63Q05C16 580 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 MAPK7Q13164 816 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 DAW1Q8N136 415 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 PARVGQ9HBI0 331 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 ARIH2O95376 493 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 LY6KQ17RY6 165 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 ANO5Q75V66 913 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 TSG101Q99816 390 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 ODF2LQ9ULJ1 636 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD10-201ENST00000249501 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 STBD1O95210 358 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 GCNT3O95395 438 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 ADORA2AP29274 412 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 HOXD13P35453 343 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 ZNF131P52739 623 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 XKR9Q5GH70 373 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 LRRC55Q6ZSA7 311 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 FIZ1Q96SL8 496 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 PASKQ96RG2 1323 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 PBX1P40424 430 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 GSDMDP57764 484 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 RGMBQ6NW40 437 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD10-201ENST00000249501 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms