RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227474.7

PUS3-201, Transcript of pseudouridylate synthase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PUS3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3-201ENST00000227474 FAM170AA1A519 330 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 RASA4BC9J798 803 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 RASA4O43374 803 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 E2F6O75461 281 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 PRPHP41219 470 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 SYCP1Q15431 976 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 FILIP1LQ4L180 1135 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 MFSD14BQ5SR56 506 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 CEP135Q66GS9 1140 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 MZT2AQ6P582 158 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 CCDC112Q8NEF3 446 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 CCDC148Q8NFR7 591 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 DHRS1Q96LJ7 313 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 PHOX2BQ99453 314 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 EYA3Q99504 573 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 DBNDD1Q9H9R9 158 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 EXOC1Q9NV70 894 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 FBXL5Q9UKA1 691 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 C10orf71Q711Q0 1435 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 NAV1Q8NEY1 1877 aa9.59□□□□□ -0.87
PUS3-201ENST00000227474 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 F8VZ95 297 aa9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 CAP2P40123 477 aa9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 GABPAQ06546 454 aa9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 GRM1Q13255 1194 aa9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 ZNF827Q17R98 1081 aa9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 CFAP100Q494V2 611 aa9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 ARSHQ5FYA8 562 aa9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 SPATA1Q5VX52 437 aa9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 SWSAP1Q6NVH7 229 aa9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 IQUBQ8NA54 791 aa9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 C1orf74Q96LT6 269 aa9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.59□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 TRIM64A6NGJ6 449 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 TRIM64BA6NI03 449 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 TMEM232C9JQI7 657 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 TUBB4AP04350 444 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 TOP1P11387 765 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 MCM7P33993 719 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 PLA2G4AP47712 749 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 NR1I3Q14994 352 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 TXNRD1Q16881 649 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 C10orf76Q5T2E6 689 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 TMEM139Q8IV31 216 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 CEP95Q96GE4 821 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 UIMC1Q96RL1 719 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 MTRQ99707 1265 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 ZMYND12Q9H0C1 365 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 SUFUQ9UMX1 484 aa9.58□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 NRXN2Q9P2S2 1712 aa9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 A0A1B0GTH6 734 aa9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 KLRF2D3W0D1 207 aa9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 LAD1O00515 517 aa9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 NPR1P16066 1061 aa9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 CCNCP24863 283 aa9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 DACT2Q5SW24 774 aa9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 AP1ARQ63HQ0 302 aa9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 ANKRD7Q92527 254 aa9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 JAKMIP2Q96AA8 810 aa9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.57□□□□□ -0.88
PUS3-201ENST00000227474 MYO3BQ8WXR4 1341 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms