RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	ANAPC15	P60006	121 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRR16	Q569H4	304 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	RSPH3	Q86UC2	560 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	SEPT8	Q92599	483 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SEMA3B-215	ENST00000621029	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	INSRR	P14616	1297 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPM1E	Q8WY54	764 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDKL5	O76039	1030 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	32.93	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	CERS4	Q9HA82	394 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	GBF1	Q92538	1859 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCNE2	O96020	404 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLCB4	Q15147	1175 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	AMH	P03971	560 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	ANKRD1	Q15327	319 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDH23	Q9H251	3354 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATG7	O95352	703 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	SCRN1	Q12765	414 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	POTEB3	A0JP26	581 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC26A2	P50443	739 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADGRE1	Q14246	886 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM26D	Q5JW98	314 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	POTEB	Q6S5H4	581 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	32.89	■■■□□ 2.86	8e-7	■□□□□ 8.5
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	AIFM3	Q96NN9	605 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF302	Q9NR11	478 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SEMA3B-215	ENST00000621029	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	CIITA	P33076	1130 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	AK2	P54819	239 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	BLID	Q8IZY5	108 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	GJB5	O95377	273 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	CHRNA1	P02708	482 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	TAP1	Q03518	808 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	RPAIN	Q86UA6	219 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	TBCK	Q8TEA7	893 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	RAD9A	Q99638	391 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	SAMM50	Q9Y512	469 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	KAT6A	Q92794	2004 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	PFKFB2	O60825	505 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	GHR	P10912	638 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP11	P51784	963 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	LCHN	A4D1U4	455 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARHGEF15	O94989	841 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	KRT76	Q01546	638 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	GALNT17	Q6IS24	598 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	APBB2	Q92870	758 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029		M0QZ92	97 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	RFXAP	O00287	272 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	DTNB	O60941	627 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	PSAP	P07602	524 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	XBP1	P17861	261 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP38	Q8NB14	1042 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYO9B	Q13459	2157 aa		32.84	■■■□□ 2.85

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