RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593586.1

TTC9B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

Gene TTC9B, Length 2,323 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-202ENST00000593586 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 TRIM66O15016 1216 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 OPA1O60313 960 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 DNA2P51530 1060 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 NNTQ13423 1086 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 ERMNQ8TAM6 284 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 NYAP2Q9P242 653 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 GLI1P08151 1106 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 PSMC6P62333 389 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 PPFIA1Q13136 1202 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 GDF3Q9NR23 364 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 DNM3Q9UQ16 869 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 TBX3O15119 743 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 FAM196BA6NMK8 535 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 MEIS1O00470 390 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 HSF2BPO75031 334 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 ACTN1P12814 892 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 RPA1P27694 616 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 SLC20A2Q08357 652 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 SFR1Q86XK3 245 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 RUFY1Q96T51 708 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 REEP2Q9BRK0 252 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 TMEM51Q9NW97 253 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 CRKP46108 304 aa22.1■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 Q4G0T1 1027 aa22.1■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.1■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.1■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 BTNL10A8MVZ5 291 aa22.09■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 UCHL3P15374 230 aa22.09■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 SLC9A1P19634 815 aa22.09■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 HOXD13P35453 343 aa22.09■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 CARSP49589 748 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 PTK2Q05397 1052 aa22.09■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.09■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 MCTP2Q6DN12 878 aa22.09■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 LENG9Q96B70 501 aa22.09■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 SPAG5Q96R06 1193 aa22.09■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.09■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 AMNQ9BXJ7 453 aa22.09■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 NFU1Q9UMS0 254 aa22.09■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 PDXKO00764 312 aa22.08■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 CACNB3P54284 484 aa22.08■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 GUCY2DQ02846 1103 aa22.08■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 TCP10Q12799 353 aa22.08■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 PAK2Q13177 524 aa22.08■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.08■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 GBP6Q6ZN66 633 aa22.08■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 KRT12Q99456 494 aa22.08■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TTC9B-202ENST00000593586 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 G3V3G9 751 aa22.08■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 MYBP10242 640 aa22.08■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 IRAK1P51617 712 aa22.08■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.08■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.08■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 ESYT3A0FGR9 886 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 FAM86B1E9PN63 330 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 PON1P27169 355 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 SNAP25P60880 206 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 ARL8AQ96BM9 186 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 FAM20AQ96MK3 541 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 ZIM3Q96PE6 472 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 STK24Q9Y6E0 443 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 AKAP3O75969 853 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 SREBF1P36956 1147 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 ICA1Q05084 483 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 TTMPQ5BVD1 217 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 IFT81Q8WYA0 676 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 TAF4BQ92750 862 aa22.07■■□□□ 1.12
TTC9B-202ENST00000593586 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms