RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 GRPEL1Q9HAV7 217 aa34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-206ENST00000588815 ARID2Q68CP9 1835 aa34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 RGS2P41220 211 aa34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC12A3P55017 1021 aa34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMC5P62195 406 aa34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL7BQ6UX53 244 aa34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 C4orf19Q8IY42 314 aa34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ATG7O95352 703 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CASP1P29466 404 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF165P49910 485 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 FCGRTP55899 365 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTR2P61160 394 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC62Q6P9F0 684 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CYFIP1Q7L576 1253 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 NPLOC4Q8TAT6 608 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 BPIFA3Q9BQP9 254 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 MYMKA6NI61 221 aa34.61■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ASIC1P78348 528 aa34.61■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 DPCR1Q3MIW9 517 aa34.61■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 BANK1Q8NDB2 785 aa34.61■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6V0A1Q93050 837 aa34.61■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 KCND2Q9NZV8 630 aa34.61■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 RHOBTB3O94955 611 aa34.6■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMC6P62333 389 aa34.6■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ABHD15Q6UXT9 468 aa34.6■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 KLRC4O43908 158 aa34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 UVSSAQ2YD98 709 aa34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 OLFML2BQ68BL8 750 aa34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 UNC13DQ70J99 1090 aa34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX12PQ92771 950 aa34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 APBA2Q99767 749 aa34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 GJD2Q9UKL4 321 aa34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 GGPS1O95749 300 aa34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 VEGFBP49765 207 aa34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 TAPT1Q6NXT6 567 aa34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 GPBP1Q86WP2 473 aa34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 KATNBL1Q9H079 304 aa34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 BHMT2Q9H2M3 363 aa34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 MLXIPQ9HAP2 919 aa34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 TXNP10599 105 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP11B2P19099 503 aa34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa34.57■■■■□ 3.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ARIH2O95376 493 aa34.57■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 BMP6P22004 513 aa34.57■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 LY6KQ17RY6 165 aa34.57■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 KMT5BQ4FZB7 885 aa34.57■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ISM2Q6H9L7 571 aa34.57■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 EXOC1Q9NV70 894 aa34.57■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF22Q14807 665 aa34.56■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF214Q8ND24 703 aa34.56■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 PIGOQ8TEQ8 1089 aa34.56■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 SEPT1Q8WYJ6 367 aa34.56■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC19Q96DA6 116 aa34.56■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 BCAS3Q9H6U6 928 aa34.56■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 CBX8Q9HC52 389 aa34.56■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKEF1Q9NU02 776 aa34.56■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa34.55■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R2P41236 205 aa34.55■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMD2Q13200 908 aa34.55■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A087WWV3 80 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMC4P43686 418 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 SP3Q02447 781 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC65Q8IXS2 484 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF186Q9NXI6 227 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 GABBR1Q9UBS5 961 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 YWHABP31946 246 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ACVR2BQ13705 512 aa34.53■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 IQSEC1Q6DN90 963 aa34.53■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 SWSAP1Q6NVH7 229 aa34.53■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 OTUD6AQ7L8S5 288 aa34.53■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 DYMQ7RTS9 669 aa34.53■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 PDGFCQ9NRA1 345 aa34.53■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF35A5YM69 484 aa34.52■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT18P05783 430 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 SP4Q02446 784 aa34.52■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 LAMC2Q13753 1193 aa34.52■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 IQCB1Q15051 598 aa34.52■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ARSHQ5FYA8 562 aa34.52■■■■□ 3.12
CAPNS1-206ENST00000588815 RINT1Q6NUQ1 792 aa34.52■■■■□ 3.12
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