RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.15■■□□□ 1.14
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TRAF4-216ENST00000586813 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAF4-216ENST00000586813 CTNNB1P35222 781 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 NAPAP54920 295 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 IGBP1P78318 339 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 CD320Q9NPF0 282 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 LINC00271P0C7V0 271 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 INSRRP14616 1297 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 PGBD1Q96JS3 809 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 NEK1Q96PY6 1258 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 SDF4Q9BRK5 362 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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TRAF4-216ENST00000586813 AZI2Q9H6S1 392 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 NFASCO94856 1347 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 ENPP3O14638 875 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 IL9P15248 144 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 FUT2Q10981 343 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 RTN1Q16799 776 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 NEK9Q8TD19 979 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 TRPC6Q9Y210 931 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 ZBTB43O43298 467 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 ADCY7P51828 1080 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 ACTR2P61160 394 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 COL19A1Q14993 1142 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.11■■□□□ 1.13
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TRAF4-216ENST00000586813 ANO3Q9BYT9 981 aa22.11■■□□□ 1.13
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TRAF4-216ENST00000586813 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.1■■□□□ 1.13
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TRAF4-216ENST00000586813 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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TRAF4-216ENST00000586813 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.09■■□□□ 1.13
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TRAF4-216ENST00000586813 SQORQ9Y6N5 450 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 GRM6O15303 877 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 STAT5BP51692 787 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAF4-216ENST00000586813 AP3B2Q13367 1082 aa22.08■■□□□ 1.13
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