RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580445.5

OGFOD3-208, Transcript of 2-oxoglutarate and iron dependent oxygenase domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OGFOD3, Length 1,274 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OGFOD3-208ENST00000580445 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 SPRED2Q7Z698 418 aa24.39■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.39■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 ARNTL2Q8WYA1 636 aa24.39■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.39■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.39■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.39■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 GJB5O95377 273 aa24.38■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 UIMC1Q96RL1 719 aa24.38■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 AZI2Q9H6S1 392 aa24.38■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 FAM86B1E9PN63 330 aa24.37■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.37■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 IFNAR1P17181 557 aa24.37■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 EVCP57679 992 aa24.37■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.37■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.37■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.37■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 SEPT8Q92599 483 aa24.37■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.37■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 NLRC5Q86WI3 1866 aa24.36■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 EVPLQ92817 2033 aa24.36■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 GNA11P29992 359 aa24.36■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.36■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 NIPA1Q7RTP0 329 aa24.36■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 RAD9AQ99638 391 aa24.36■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 VPS54Q9P1Q0 977 aa24.36■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 TRPC6Q9Y210 931 aa24.36■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 AMHP03971 560 aa24.35■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 CYP3A4P08684 503 aa24.35■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 INSRRP14616 1297 aa24.35■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 FAM26DQ5JW98 314 aa24.35■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.35■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.35■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 CRYGNQ8WXF5 182 aa24.35■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa24.34■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 CCNE2O96020 404 aa24.34■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 CHRNA1P02708 482 aa24.34■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 STAT5BP51692 787 aa24.34■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 STK3Q13188 491 aa24.34■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 PLCB4Q15147 1175 aa24.34■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 MCTP2Q6DN12 878 aa24.34■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 RSPH3Q86UC2 560 aa24.34■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.34■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.34■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.34■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 MTUS1Q9ULD2 1270 aa24.34■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 GHRP10912 638 aa24.33■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 KRT40Q6A162 431 aa24.33■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa24.33■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 RPAINQ86UA6 219 aa24.33■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 BICD2Q8TD16 824 aa24.33■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
OGFOD3-208ENST00000580445 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.32■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 BACH1O14867 736 aa24.32■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 ATG7O95352 703 aa24.32■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 MGAT3Q09327 533 aa24.32■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.32■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 ZNF577Q9BSK1 485 aa24.32■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.32■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 THEGQ9P2T0 379 aa24.32■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 MTCH2Q9Y6C9 303 aa24.32■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 POTEB3A0JP26 581 aa24.31■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 LINC01553A4QN01 128 aa24.31■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 CPLX1O14810 134 aa24.31■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 DHX15O43143 795 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 UPP2O95045 317 aa24.31■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 SETQ01105 290 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 POTEBQ6S5H4 581 aa24.31■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 ABHD15Q6UXT9 468 aa24.31■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 GDPD5Q8WTR4 605 aa24.31■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 APBB2Q92870 758 aa24.31■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 INSL6Q9Y581 213 aa24.31■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 CDY2AQ9Y6F7 541 aa24.31■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 NLRP5P59047 1200 aa24.3■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 GRB10Q13322 594 aa24.3■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 LPIN1Q14693 890 aa24.3■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 PRR16Q569H4 304 aa24.3■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 FAM160B1Q5W0V3 765 aa24.3■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa24.29■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 TMEM62Q0P6H9 643 aa24.29■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.29■■□□□ 1.48
OGFOD3-208ENST00000580445 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms