RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	IGBP1	P78318	339 aa		10.69	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	TAP1	Q03518	808 aa		10.69	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		10.69	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	10.69	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		10.69	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		10.69	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		10.69	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		10.69	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	TRPC6	Q9Y210	931 aa		10.69	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	RFXAP	O00287	272 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	BACH1	O14867	736 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	CHRNA1	P02708	482 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC26A2	P50443	739 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	STK3	Q13188	491 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	PLCB4	Q15147	1175 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	USP38	Q8NB14	1042 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	APBB2	Q92870	758 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	UIMC1	Q96RL1	719 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	INSL6	Q9Y581	213 aa		10.68	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	SCN5A	Q14524	2016 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	POTEB3	A0JP26	581 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	LCHN	A4D1U4	455 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGEF15	O94989	841 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	DEXI	O95424	95 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	CCNE2	O96020	404 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	CIITA	P33076	1130 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	USP11	P51784	963 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	PRR16	Q569H4	304 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	IER5	Q5VY09	327 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	POTEB	Q6S5H4	581 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	NME8	Q8N427	588 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF302	Q9NR11	478 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		10.67	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	HBP1	O60381	514 aa		10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	UPP2	O95045	317 aa		10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	GHR	P10912	638 aa		10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	ANAPC15	P60006	121 aa		10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	MGAT3	Q09327	533 aa		10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	TOP1MT	Q969P6	601 aa		10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		10.66	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	EPOP	A6NHQ4	379 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479		M0QZ92	97 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	ENPP3	O14638	875 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	CDKL5	O76039	1030 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	PSAP	P07602	524 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	KLRC1	P26715	233 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	ERVK-21	P61565	698 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	KRT76	Q01546	638 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	SCRN1	Q12765	414 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	LPIN1	Q14693	890 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD1	Q15327	319 aa		10.65	□□□□□ -0.7

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